Protein–RNA interactions for Protein: Q9P244

LRFN1, Leucine-rich repeat and fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN1Q9P244 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LRFN1Q9P244 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRFN1Q9P244 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRFN1Q9P244 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LRFN1Q9P244 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRFN1Q9P244 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRFN1Q9P244 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRFN1Q9P244 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRFN1Q9P244 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRFN1Q9P244 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
LRFN1Q9P244 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRFN1Q9P244 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRFN1Q9P244 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRFN1Q9P244 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRFN1Q9P244 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRFN1Q9P244 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRFN1Q9P244 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRFN1Q9P244 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRFN1Q9P244 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRFN1Q9P244 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRFN1Q9P244 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRFN1Q9P244 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRFN1Q9P244 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRFN1Q9P244 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRFN1Q9P244 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRFN1Q9P244 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRFN1Q9P244 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRFN1Q9P244 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRFN1Q9P244 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRFN1Q9P244 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRFN1Q9P244 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRFN1Q9P244 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRFN1Q9P244 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
LRFN1Q9P244 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRFN1Q9P244 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRFN1Q9P244 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRFN1Q9P244 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRFN1Q9P244 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRFN1Q9P244 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRFN1Q9P244 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRFN1Q9P244 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRFN1Q9P244 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRFN1Q9P244 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRFN1Q9P244 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRFN1Q9P244 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRFN1Q9P244 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRFN1Q9P244 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRFN1Q9P244 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRFN1Q9P244 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRFN1Q9P244 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRFN1Q9P244 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRFN1Q9P244 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRFN1Q9P244 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRFN1Q9P244 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRFN1Q9P244 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRFN1Q9P244 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRFN1Q9P244 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRFN1Q9P244 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRFN1Q9P244 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRFN1Q9P244 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRFN1Q9P244 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRFN1Q9P244 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRFN1Q9P244 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRFN1Q9P244 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRFN1Q9P244 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRFN1Q9P244 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRFN1Q9P244 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LRFN1Q9P244 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRFN1Q9P244 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRFN1Q9P244 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRFN1Q9P244 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRFN1Q9P244 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRFN1Q9P244 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LRFN1Q9P244 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRFN1Q9P244 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRFN1Q9P244 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRFN1Q9P244 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRFN1Q9P244 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LRFN1Q9P244 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRFN1Q9P244 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRFN1Q9P244 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRFN1Q9P244 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRFN1Q9P244 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRFN1Q9P244 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRFN1Q9P244 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRFN1Q9P244 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRFN1Q9P244 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRFN1Q9P244 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRFN1Q9P244 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRFN1Q9P244 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRFN1Q9P244 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRFN1Q9P244 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRFN1Q9P244 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LRFN1Q9P244 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRFN1Q9P244 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRFN1Q9P244 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRFN1Q9P244 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRFN1Q9P244 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRFN1Q9P244 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRFN1Q9P244 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms