Protein–RNA interactions for Protein: Q9P209

CEP72, Centrosomal protein of 72 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP72Q9P209 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CEP72Q9P209 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CEP72Q9P209 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CEP72Q9P209 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CEP72Q9P209 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CEP72Q9P209 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CEP72Q9P209 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CEP72Q9P209 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CEP72Q9P209 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CEP72Q9P209 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CEP72Q9P209 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CEP72Q9P209 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CEP72Q9P209 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CEP72Q9P209 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CEP72Q9P209 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CEP72Q9P209 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CEP72Q9P209 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CEP72Q9P209 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CEP72Q9P209 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CEP72Q9P209 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CEP72Q9P209 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CEP72Q9P209 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CEP72Q9P209 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CEP72Q9P209 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CEP72Q9P209 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CEP72Q9P209 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CEP72Q9P209 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CEP72Q9P209 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CEP72Q9P209 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CEP72Q9P209 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CEP72Q9P209 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CEP72Q9P209 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CEP72Q9P209 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CEP72Q9P209 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CEP72Q9P209 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CEP72Q9P209 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CEP72Q9P209 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CEP72Q9P209 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CEP72Q9P209 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CEP72Q9P209 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CEP72Q9P209 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CEP72Q9P209 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CEP72Q9P209 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CEP72Q9P209 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CEP72Q9P209 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP72Q9P209 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CEP72Q9P209 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CEP72Q9P209 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CEP72Q9P209 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CEP72Q9P209 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CEP72Q9P209 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CEP72Q9P209 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CEP72Q9P209 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CEP72Q9P209 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CEP72Q9P209 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CEP72Q9P209 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CEP72Q9P209 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CEP72Q9P209 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CEP72Q9P209 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CEP72Q9P209 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CEP72Q9P209 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CEP72Q9P209 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CEP72Q9P209 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CEP72Q9P209 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CEP72Q9P209 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CEP72Q9P209 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CEP72Q9P209 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CEP72Q9P209 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CEP72Q9P209 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CEP72Q9P209 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CEP72Q9P209 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CEP72Q9P209 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CEP72Q9P209 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CEP72Q9P209 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CEP72Q9P209 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CEP72Q9P209 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CEP72Q9P209 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CEP72Q9P209 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CEP72Q9P209 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CEP72Q9P209 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CEP72Q9P209 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CEP72Q9P209 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CEP72Q9P209 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CEP72Q9P209 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CEP72Q9P209 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CEP72Q9P209 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CEP72Q9P209 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CEP72Q9P209 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CEP72Q9P209 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CEP72Q9P209 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CEP72Q9P209 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CEP72Q9P209 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CEP72Q9P209 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CEP72Q9P209 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CEP72Q9P209 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CEP72Q9P209 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CEP72Q9P209 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CEP72Q9P209 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CEP72Q9P209 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CEP72Q9P209 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms