Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV4

CDK12, Cyclin-dependent kinase 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK12Q9NYV4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CDK12Q9NYV4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
CDK12Q9NYV4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
CDK12Q9NYV4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
CDK12Q9NYV4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
CDK12Q9NYV4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
CDK12Q9NYV4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC35.99■■■■□ 3.35
CDK12Q9NYV4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
CDK12Q9NYV4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CDK12Q9NYV4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CDK12Q9NYV4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CDK12Q9NYV4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CDK12Q9NYV4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CDK12Q9NYV4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
CDK12Q9NYV4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CDK12Q9NYV4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CDK12Q9NYV4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CDK12Q9NYV4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
CDK12Q9NYV4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CDK12Q9NYV4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
CDK12Q9NYV4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
CDK12Q9NYV4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
CDK12Q9NYV4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
CDK12Q9NYV4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
CDK12Q9NYV4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
CDK12Q9NYV4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
CDK12Q9NYV4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
CDK12Q9NYV4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CDK12Q9NYV4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CDK12Q9NYV4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
CDK12Q9NYV4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
CDK12Q9NYV4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
CDK12Q9NYV4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
CDK12Q9NYV4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CDK12Q9NYV4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
CDK12Q9NYV4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
CDK12Q9NYV4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
CDK12Q9NYV4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
CDK12Q9NYV4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CDK12Q9NYV4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
CDK12Q9NYV4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CDK12Q9NYV4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CDK12Q9NYV4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
CDK12Q9NYV4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
CDK12Q9NYV4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
CDK12Q9NYV4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
CDK12Q9NYV4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
CDK12Q9NYV4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CDK12Q9NYV4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
CDK12Q9NYV4 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
CDK12Q9NYV4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
CDK12Q9NYV4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CDK12Q9NYV4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
CDK12Q9NYV4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CDK12Q9NYV4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
CDK12Q9NYV4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
CDK12Q9NYV4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
CDK12Q9NYV4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
CDK12Q9NYV4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
CDK12Q9NYV4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
CDK12Q9NYV4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
CDK12Q9NYV4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
CDK12Q9NYV4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
CDK12Q9NYV4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
CDK12Q9NYV4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
CDK12Q9NYV4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
CDK12Q9NYV4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
CDK12Q9NYV4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.7■■■■□ 3.31
CDK12Q9NYV4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
CDK12Q9NYV4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC35.7■■■■□ 3.31
CDK12Q9NYV4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC35.7■■■■□ 3.31
CDK12Q9NYV4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC35.69■■■■□ 3.3
CDK12Q9NYV4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
CDK12Q9NYV4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
CDK12Q9NYV4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
CDK12Q9NYV4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
CDK12Q9NYV4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
CDK12Q9NYV4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CDK12Q9NYV4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CDK12Q9NYV4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
CDK12Q9NYV4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
CDK12Q9NYV4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
CDK12Q9NYV4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
CDK12Q9NYV4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
CDK12Q9NYV4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
CDK12Q9NYV4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
CDK12Q9NYV4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
CDK12Q9NYV4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
CDK12Q9NYV4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
CDK12Q9NYV4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
CDK12Q9NYV4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
CDK12Q9NYV4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
CDK12Q9NYV4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
CDK12Q9NYV4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
CDK12Q9NYV4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
CDK12Q9NYV4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
CDK12Q9NYV4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
CDK12Q9NYV4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
CDK12Q9NYV4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
CDK12Q9NYV4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms