Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXK8

FBXL12, F-box/LRR-repeat protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL12Q9NXK8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FBXL12Q9NXK8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FBXL12Q9NXK8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FBXL12Q9NXK8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FBXL12Q9NXK8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FBXL12Q9NXK8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FBXL12Q9NXK8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FBXL12Q9NXK8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FBXL12Q9NXK8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FBXL12Q9NXK8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FBXL12Q9NXK8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FBXL12Q9NXK8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FBXL12Q9NXK8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FBXL12Q9NXK8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FBXL12Q9NXK8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FBXL12Q9NXK8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
FBXL12Q9NXK8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
FBXL12Q9NXK8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FBXL12Q9NXK8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FBXL12Q9NXK8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
FBXL12Q9NXK8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FBXL12Q9NXK8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FBXL12Q9NXK8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FBXL12Q9NXK8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FBXL12Q9NXK8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FBXL12Q9NXK8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FBXL12Q9NXK8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FBXL12Q9NXK8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FBXL12Q9NXK8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FBXL12Q9NXK8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FBXL12Q9NXK8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FBXL12Q9NXK8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FBXL12Q9NXK8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FBXL12Q9NXK8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FBXL12Q9NXK8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FBXL12Q9NXK8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FBXL12Q9NXK8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FBXL12Q9NXK8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FBXL12Q9NXK8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FBXL12Q9NXK8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FBXL12Q9NXK8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FBXL12Q9NXK8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FBXL12Q9NXK8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FBXL12Q9NXK8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FBXL12Q9NXK8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FBXL12Q9NXK8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
FBXL12Q9NXK8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FBXL12Q9NXK8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FBXL12Q9NXK8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FBXL12Q9NXK8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FBXL12Q9NXK8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FBXL12Q9NXK8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
FBXL12Q9NXK8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FBXL12Q9NXK8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FBXL12Q9NXK8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FBXL12Q9NXK8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FBXL12Q9NXK8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FBXL12Q9NXK8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FBXL12Q9NXK8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FBXL12Q9NXK8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FBXL12Q9NXK8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
FBXL12Q9NXK8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FBXL12Q9NXK8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FBXL12Q9NXK8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FBXL12Q9NXK8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FBXL12Q9NXK8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FBXL12Q9NXK8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
FBXL12Q9NXK8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FBXL12Q9NXK8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FBXL12Q9NXK8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FBXL12Q9NXK8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FBXL12Q9NXK8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FBXL12Q9NXK8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FBXL12Q9NXK8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FBXL12Q9NXK8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FBXL12Q9NXK8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FBXL12Q9NXK8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FBXL12Q9NXK8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FBXL12Q9NXK8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
FBXL12Q9NXK8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FBXL12Q9NXK8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FBXL12Q9NXK8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FBXL12Q9NXK8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FBXL12Q9NXK8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FBXL12Q9NXK8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FBXL12Q9NXK8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FBXL12Q9NXK8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FBXL12Q9NXK8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FBXL12Q9NXK8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FBXL12Q9NXK8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FBXL12Q9NXK8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FBXL12Q9NXK8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
FBXL12Q9NXK8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FBXL12Q9NXK8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FBXL12Q9NXK8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FBXL12Q9NXK8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FBXL12Q9NXK8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FBXL12Q9NXK8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FBXL12Q9NXK8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FBXL12Q9NXK8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms