Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG2

THUMPD1, THUMP domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD1Q9NXG2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
THUMPD1Q9NXG2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
THUMPD1Q9NXG2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
THUMPD1Q9NXG2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
THUMPD1Q9NXG2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
THUMPD1Q9NXG2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
THUMPD1Q9NXG2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
THUMPD1Q9NXG2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
THUMPD1Q9NXG2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
THUMPD1Q9NXG2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
THUMPD1Q9NXG2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
THUMPD1Q9NXG2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
THUMPD1Q9NXG2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
THUMPD1Q9NXG2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
THUMPD1Q9NXG2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
THUMPD1Q9NXG2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
THUMPD1Q9NXG2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
THUMPD1Q9NXG2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
THUMPD1Q9NXG2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
THUMPD1Q9NXG2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
THUMPD1Q9NXG2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
THUMPD1Q9NXG2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
THUMPD1Q9NXG2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
THUMPD1Q9NXG2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
THUMPD1Q9NXG2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
THUMPD1Q9NXG2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
THUMPD1Q9NXG2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
THUMPD1Q9NXG2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
THUMPD1Q9NXG2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
THUMPD1Q9NXG2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
THUMPD1Q9NXG2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
THUMPD1Q9NXG2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
THUMPD1Q9NXG2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
THUMPD1Q9NXG2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
THUMPD1Q9NXG2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
THUMPD1Q9NXG2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
THUMPD1Q9NXG2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
THUMPD1Q9NXG2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
THUMPD1Q9NXG2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
THUMPD1Q9NXG2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
THUMPD1Q9NXG2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
THUMPD1Q9NXG2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
THUMPD1Q9NXG2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
THUMPD1Q9NXG2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
THUMPD1Q9NXG2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
THUMPD1Q9NXG2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
THUMPD1Q9NXG2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
THUMPD1Q9NXG2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
THUMPD1Q9NXG2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
THUMPD1Q9NXG2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
THUMPD1Q9NXG2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
THUMPD1Q9NXG2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
THUMPD1Q9NXG2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
THUMPD1Q9NXG2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
THUMPD1Q9NXG2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
THUMPD1Q9NXG2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
THUMPD1Q9NXG2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
THUMPD1Q9NXG2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
THUMPD1Q9NXG2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
THUMPD1Q9NXG2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
THUMPD1Q9NXG2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
THUMPD1Q9NXG2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
THUMPD1Q9NXG2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
THUMPD1Q9NXG2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
THUMPD1Q9NXG2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
THUMPD1Q9NXG2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
THUMPD1Q9NXG2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
THUMPD1Q9NXG2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
THUMPD1Q9NXG2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
THUMPD1Q9NXG2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
THUMPD1Q9NXG2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
THUMPD1Q9NXG2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
THUMPD1Q9NXG2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
THUMPD1Q9NXG2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
THUMPD1Q9NXG2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
THUMPD1Q9NXG2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
THUMPD1Q9NXG2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
THUMPD1Q9NXG2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
THUMPD1Q9NXG2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
THUMPD1Q9NXG2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
THUMPD1Q9NXG2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
THUMPD1Q9NXG2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
THUMPD1Q9NXG2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
THUMPD1Q9NXG2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
THUMPD1Q9NXG2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
THUMPD1Q9NXG2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
THUMPD1Q9NXG2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
THUMPD1Q9NXG2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
THUMPD1Q9NXG2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
THUMPD1Q9NXG2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
THUMPD1Q9NXG2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
THUMPD1Q9NXG2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
THUMPD1Q9NXG2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
THUMPD1Q9NXG2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
THUMPD1Q9NXG2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
THUMPD1Q9NXG2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
THUMPD1Q9NXG2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
THUMPD1Q9NXG2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
THUMPD1Q9NXG2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
THUMPD1Q9NXG2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.3 ms