Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW0

HCFC1R1, Host cell factor C1 regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCFC1R1Q9NWW0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
HCFC1R1Q9NWW0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HCFC1R1Q9NWW0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HCFC1R1Q9NWW0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HCFC1R1Q9NWW0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HCFC1R1Q9NWW0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HCFC1R1Q9NWW0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HCFC1R1Q9NWW0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HCFC1R1Q9NWW0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HCFC1R1Q9NWW0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HCFC1R1Q9NWW0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HCFC1R1Q9NWW0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HCFC1R1Q9NWW0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HCFC1R1Q9NWW0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HCFC1R1Q9NWW0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HCFC1R1Q9NWW0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HCFC1R1Q9NWW0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HCFC1R1Q9NWW0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HCFC1R1Q9NWW0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HCFC1R1Q9NWW0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HCFC1R1Q9NWW0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HCFC1R1Q9NWW0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HCFC1R1Q9NWW0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HCFC1R1Q9NWW0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HCFC1R1Q9NWW0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HCFC1R1Q9NWW0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HCFC1R1Q9NWW0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HCFC1R1Q9NWW0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HCFC1R1Q9NWW0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HCFC1R1Q9NWW0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HCFC1R1Q9NWW0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HCFC1R1Q9NWW0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HCFC1R1Q9NWW0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HCFC1R1Q9NWW0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HCFC1R1Q9NWW0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HCFC1R1Q9NWW0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HCFC1R1Q9NWW0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HCFC1R1Q9NWW0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HCFC1R1Q9NWW0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HCFC1R1Q9NWW0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HCFC1R1Q9NWW0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HCFC1R1Q9NWW0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HCFC1R1Q9NWW0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HCFC1R1Q9NWW0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HCFC1R1Q9NWW0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HCFC1R1Q9NWW0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HCFC1R1Q9NWW0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HCFC1R1Q9NWW0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HCFC1R1Q9NWW0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HCFC1R1Q9NWW0 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
HCFC1R1Q9NWW0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HCFC1R1Q9NWW0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HCFC1R1Q9NWW0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HCFC1R1Q9NWW0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HCFC1R1Q9NWW0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HCFC1R1Q9NWW0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
HCFC1R1Q9NWW0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HCFC1R1Q9NWW0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HCFC1R1Q9NWW0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HCFC1R1Q9NWW0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HCFC1R1Q9NWW0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HCFC1R1Q9NWW0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HCFC1R1Q9NWW0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HCFC1R1Q9NWW0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HCFC1R1Q9NWW0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
HCFC1R1Q9NWW0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HCFC1R1Q9NWW0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HCFC1R1Q9NWW0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
HCFC1R1Q9NWW0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HCFC1R1Q9NWW0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HCFC1R1Q9NWW0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HCFC1R1Q9NWW0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HCFC1R1Q9NWW0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HCFC1R1Q9NWW0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
HCFC1R1Q9NWW0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HCFC1R1Q9NWW0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HCFC1R1Q9NWW0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HCFC1R1Q9NWW0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HCFC1R1Q9NWW0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HCFC1R1Q9NWW0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HCFC1R1Q9NWW0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HCFC1R1Q9NWW0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HCFC1R1Q9NWW0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HCFC1R1Q9NWW0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
HCFC1R1Q9NWW0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
HCFC1R1Q9NWW0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HCFC1R1Q9NWW0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HCFC1R1Q9NWW0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HCFC1R1Q9NWW0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HCFC1R1Q9NWW0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HCFC1R1Q9NWW0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HCFC1R1Q9NWW0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
HCFC1R1Q9NWW0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HCFC1R1Q9NWW0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HCFC1R1Q9NWW0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HCFC1R1Q9NWW0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HCFC1R1Q9NWW0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HCFC1R1Q9NWW0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HCFC1R1Q9NWW0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HCFC1R1Q9NWW0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms