Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV44

LINC00846, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00846, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00846Q9NV44 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LINC00846Q9NV44 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00846Q9NV44 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00846Q9NV44 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00846Q9NV44 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00846Q9NV44 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00846Q9NV44 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00846Q9NV44 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00846Q9NV44 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00846Q9NV44 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00846Q9NV44 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00846Q9NV44 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00846Q9NV44 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00846Q9NV44 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00846Q9NV44 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00846Q9NV44 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00846Q9NV44 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00846Q9NV44 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00846Q9NV44 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00846Q9NV44 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00846Q9NV44 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00846Q9NV44 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00846Q9NV44 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00846Q9NV44 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00846Q9NV44 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00846Q9NV44 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00846Q9NV44 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00846Q9NV44 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00846Q9NV44 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00846Q9NV44 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00846Q9NV44 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00846Q9NV44 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00846Q9NV44 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00846Q9NV44 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00846Q9NV44 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00846Q9NV44 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00846Q9NV44 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00846Q9NV44 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00846Q9NV44 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00846Q9NV44 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00846Q9NV44 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00846Q9NV44 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00846Q9NV44 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00846Q9NV44 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00846Q9NV44 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00846Q9NV44 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00846Q9NV44 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00846Q9NV44 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00846Q9NV44 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00846Q9NV44 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00846Q9NV44 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00846Q9NV44 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00846Q9NV44 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00846Q9NV44 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00846Q9NV44 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00846Q9NV44 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00846Q9NV44 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00846Q9NV44 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00846Q9NV44 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00846Q9NV44 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00846Q9NV44 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00846Q9NV44 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00846Q9NV44 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00846Q9NV44 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00846Q9NV44 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00846Q9NV44 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00846Q9NV44 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00846Q9NV44 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00846Q9NV44 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00846Q9NV44 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00846Q9NV44 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00846Q9NV44 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00846Q9NV44 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00846Q9NV44 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00846Q9NV44 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00846Q9NV44 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00846Q9NV44 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00846Q9NV44 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00846Q9NV44 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00846Q9NV44 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00846Q9NV44 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00846Q9NV44 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00846Q9NV44 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00846Q9NV44 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00846Q9NV44 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00846Q9NV44 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00846Q9NV44 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00846Q9NV44 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00846Q9NV44 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00846Q9NV44 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00846Q9NV44 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00846Q9NV44 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00846Q9NV44 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00846Q9NV44 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00846Q9NV44 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00846Q9NV44 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00846Q9NV44 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00846Q9NV44 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00846Q9NV44 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00846Q9NV44 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms