Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTNNBIP1Q9NSA3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTNNBIP1Q9NSA3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTNNBIP1Q9NSA3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTNNBIP1Q9NSA3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTNNBIP1Q9NSA3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTNNBIP1Q9NSA3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTNNBIP1Q9NSA3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTNNBIP1Q9NSA3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CTNNBIP1Q9NSA3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTNNBIP1Q9NSA3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTNNBIP1Q9NSA3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTNNBIP1Q9NSA3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTNNBIP1Q9NSA3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTNNBIP1Q9NSA3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTNNBIP1Q9NSA3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CTNNBIP1Q9NSA3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTNNBIP1Q9NSA3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTNNBIP1Q9NSA3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTNNBIP1Q9NSA3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTNNBIP1Q9NSA3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTNNBIP1Q9NSA3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTNNBIP1Q9NSA3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTNNBIP1Q9NSA3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTNNBIP1Q9NSA3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTNNBIP1Q9NSA3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTNNBIP1Q9NSA3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTNNBIP1Q9NSA3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTNNBIP1Q9NSA3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTNNBIP1Q9NSA3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTNNBIP1Q9NSA3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTNNBIP1Q9NSA3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTNNBIP1Q9NSA3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CTNNBIP1Q9NSA3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTNNBIP1Q9NSA3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTNNBIP1Q9NSA3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTNNBIP1Q9NSA3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTNNBIP1Q9NSA3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CTNNBIP1Q9NSA3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CTNNBIP1Q9NSA3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTNNBIP1Q9NSA3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTNNBIP1Q9NSA3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTNNBIP1Q9NSA3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTNNBIP1Q9NSA3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTNNBIP1Q9NSA3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTNNBIP1Q9NSA3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTNNBIP1Q9NSA3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNBIP1Q9NSA3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNBIP1Q9NSA3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTNNBIP1Q9NSA3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTNNBIP1Q9NSA3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTNNBIP1Q9NSA3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTNNBIP1Q9NSA3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTNNBIP1Q9NSA3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTNNBIP1Q9NSA3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTNNBIP1Q9NSA3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTNNBIP1Q9NSA3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTNNBIP1Q9NSA3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTNNBIP1Q9NSA3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTNNBIP1Q9NSA3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTNNBIP1Q9NSA3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTNNBIP1Q9NSA3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTNNBIP1Q9NSA3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTNNBIP1Q9NSA3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTNNBIP1Q9NSA3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTNNBIP1Q9NSA3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CTNNBIP1Q9NSA3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTNNBIP1Q9NSA3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTNNBIP1Q9NSA3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTNNBIP1Q9NSA3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTNNBIP1Q9NSA3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTNNBIP1Q9NSA3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTNNBIP1Q9NSA3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTNNBIP1Q9NSA3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTNNBIP1Q9NSA3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTNNBIP1Q9NSA3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTNNBIP1Q9NSA3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTNNBIP1Q9NSA3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTNNBIP1Q9NSA3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTNNBIP1Q9NSA3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTNNBIP1Q9NSA3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTNNBIP1Q9NSA3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTNNBIP1Q9NSA3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTNNBIP1Q9NSA3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTNNBIP1Q9NSA3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTNNBIP1Q9NSA3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTNNBIP1Q9NSA3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTNNBIP1Q9NSA3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms