Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNX15Q9NRS6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNX15Q9NRS6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNX15Q9NRS6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNX15Q9NRS6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNX15Q9NRS6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SNX15Q9NRS6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNX15Q9NRS6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNX15Q9NRS6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNX15Q9NRS6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNX15Q9NRS6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNX15Q9NRS6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNX15Q9NRS6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNX15Q9NRS6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNX15Q9NRS6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNX15Q9NRS6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNX15Q9NRS6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNX15Q9NRS6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNX15Q9NRS6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNX15Q9NRS6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNX15Q9NRS6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX15Q9NRS6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX15Q9NRS6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX15Q9NRS6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX15Q9NRS6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX15Q9NRS6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX15Q9NRS6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX15Q9NRS6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX15Q9NRS6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX15Q9NRS6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SNX15Q9NRS6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SNX15Q9NRS6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNX15Q9NRS6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNX15Q9NRS6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNX15Q9NRS6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX15Q9NRS6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX15Q9NRS6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX15Q9NRS6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX15Q9NRS6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX15Q9NRS6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX15Q9NRS6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX15Q9NRS6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNX15Q9NRS6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNX15Q9NRS6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNX15Q9NRS6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNX15Q9NRS6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX15Q9NRS6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX15Q9NRS6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX15Q9NRS6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX15Q9NRS6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX15Q9NRS6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX15Q9NRS6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX15Q9NRS6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX15Q9NRS6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNX15Q9NRS6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX15Q9NRS6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX15Q9NRS6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX15Q9NRS6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX15Q9NRS6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX15Q9NRS6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX15Q9NRS6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX15Q9NRS6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX15Q9NRS6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX15Q9NRS6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX15Q9NRS6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX15Q9NRS6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX15Q9NRS6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX15Q9NRS6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX15Q9NRS6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX15Q9NRS6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX15Q9NRS6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX15Q9NRS6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX15Q9NRS6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX15Q9NRS6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX15Q9NRS6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNX15Q9NRS6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNX15Q9NRS6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SNX15Q9NRS6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SNX15Q9NRS6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX15Q9NRS6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX15Q9NRS6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX15Q9NRS6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX15Q9NRS6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX15Q9NRS6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX15Q9NRS6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX15Q9NRS6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNX15Q9NRS6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNX15Q9NRS6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNX15Q9NRS6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNX15Q9NRS6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX15Q9NRS6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX15Q9NRS6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX15Q9NRS6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX15Q9NRS6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX15Q9NRS6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX15Q9NRS6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX15Q9NRS6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX15Q9NRS6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX15Q9NRS6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX15Q9NRS6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms