Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR55

BATF3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BATF3Q9NR55 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BATF3Q9NR55 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BATF3Q9NR55 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BATF3Q9NR55 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BATF3Q9NR55 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BATF3Q9NR55 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BATF3Q9NR55 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BATF3Q9NR55 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BATF3Q9NR55 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BATF3Q9NR55 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BATF3Q9NR55 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BATF3Q9NR55 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BATF3Q9NR55 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BATF3Q9NR55 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BATF3Q9NR55 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
BATF3Q9NR55 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BATF3Q9NR55 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BATF3Q9NR55 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BATF3Q9NR55 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BATF3Q9NR55 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BATF3Q9NR55 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BATF3Q9NR55 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BATF3Q9NR55 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BATF3Q9NR55 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BATF3Q9NR55 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BATF3Q9NR55 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BATF3Q9NR55 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BATF3Q9NR55 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BATF3Q9NR55 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BATF3Q9NR55 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BATF3Q9NR55 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BATF3Q9NR55 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BATF3Q9NR55 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BATF3Q9NR55 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BATF3Q9NR55 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BATF3Q9NR55 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
BATF3Q9NR55 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BATF3Q9NR55 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BATF3Q9NR55 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BATF3Q9NR55 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BATF3Q9NR55 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BATF3Q9NR55 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BATF3Q9NR55 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BATF3Q9NR55 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BATF3Q9NR55 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BATF3Q9NR55 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BATF3Q9NR55 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BATF3Q9NR55 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BATF3Q9NR55 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BATF3Q9NR55 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BATF3Q9NR55 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BATF3Q9NR55 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BATF3Q9NR55 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BATF3Q9NR55 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BATF3Q9NR55 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BATF3Q9NR55 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BATF3Q9NR55 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BATF3Q9NR55 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BATF3Q9NR55 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BATF3Q9NR55 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BATF3Q9NR55 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BATF3Q9NR55 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BATF3Q9NR55 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BATF3Q9NR55 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BATF3Q9NR55 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BATF3Q9NR55 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BATF3Q9NR55 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BATF3Q9NR55 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BATF3Q9NR55 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BATF3Q9NR55 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BATF3Q9NR55 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BATF3Q9NR55 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BATF3Q9NR55 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BATF3Q9NR55 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BATF3Q9NR55 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BATF3Q9NR55 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BATF3Q9NR55 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BATF3Q9NR55 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BATF3Q9NR55 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
BATF3Q9NR55 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
BATF3Q9NR55 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BATF3Q9NR55 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BATF3Q9NR55 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BATF3Q9NR55 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BATF3Q9NR55 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BATF3Q9NR55 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BATF3Q9NR55 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BATF3Q9NR55 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BATF3Q9NR55 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BATF3Q9NR55 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BATF3Q9NR55 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
BATF3Q9NR55 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BATF3Q9NR55 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
BATF3Q9NR55 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BATF3Q9NR55 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BATF3Q9NR55 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BATF3Q9NR55 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BATF3Q9NR55 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BATF3Q9NR55 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BATF3Q9NR55 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 184.2 ms