Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR31

SAR1A, GTP-binding protein SAR1a, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAR1AQ9NR31 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SAR1AQ9NR31 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SAR1AQ9NR31 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SAR1AQ9NR31 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SAR1AQ9NR31 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SAR1AQ9NR31 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SAR1AQ9NR31 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SAR1AQ9NR31 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SAR1AQ9NR31 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SAR1AQ9NR31 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SAR1AQ9NR31 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SAR1AQ9NR31 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SAR1AQ9NR31 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SAR1AQ9NR31 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SAR1AQ9NR31 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SAR1AQ9NR31 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SAR1AQ9NR31 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SAR1AQ9NR31 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SAR1AQ9NR31 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SAR1AQ9NR31 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SAR1AQ9NR31 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SAR1AQ9NR31 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SAR1AQ9NR31 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SAR1AQ9NR31 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SAR1AQ9NR31 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SAR1AQ9NR31 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SAR1AQ9NR31 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SAR1AQ9NR31 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SAR1AQ9NR31 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SAR1AQ9NR31 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SAR1AQ9NR31 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SAR1AQ9NR31 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SAR1AQ9NR31 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SAR1AQ9NR31 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SAR1AQ9NR31 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SAR1AQ9NR31 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SAR1AQ9NR31 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SAR1AQ9NR31 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SAR1AQ9NR31 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SAR1AQ9NR31 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SAR1AQ9NR31 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SAR1AQ9NR31 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SAR1AQ9NR31 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SAR1AQ9NR31 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SAR1AQ9NR31 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SAR1AQ9NR31 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SAR1AQ9NR31 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SAR1AQ9NR31 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SAR1AQ9NR31 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SAR1AQ9NR31 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SAR1AQ9NR31 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SAR1AQ9NR31 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SAR1AQ9NR31 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SAR1AQ9NR31 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SAR1AQ9NR31 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SAR1AQ9NR31 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SAR1AQ9NR31 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SAR1AQ9NR31 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SAR1AQ9NR31 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SAR1AQ9NR31 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SAR1AQ9NR31 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SAR1AQ9NR31 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SAR1AQ9NR31 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SAR1AQ9NR31 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SAR1AQ9NR31 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SAR1AQ9NR31 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SAR1AQ9NR31 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SAR1AQ9NR31 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SAR1AQ9NR31 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SAR1AQ9NR31 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SAR1AQ9NR31 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SAR1AQ9NR31 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SAR1AQ9NR31 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SAR1AQ9NR31 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SAR1AQ9NR31 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SAR1AQ9NR31 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SAR1AQ9NR31 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SAR1AQ9NR31 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SAR1AQ9NR31 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SAR1AQ9NR31 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SAR1AQ9NR31 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SAR1AQ9NR31 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SAR1AQ9NR31 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SAR1AQ9NR31 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SAR1AQ9NR31 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SAR1AQ9NR31 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SAR1AQ9NR31 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SAR1AQ9NR31 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SAR1AQ9NR31 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SAR1AQ9NR31 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SAR1AQ9NR31 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SAR1AQ9NR31 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SAR1AQ9NR31 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SAR1AQ9NR31 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SAR1AQ9NR31 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SAR1AQ9NR31 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SAR1AQ9NR31 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SAR1AQ9NR31 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SAR1AQ9NR31 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SAR1AQ9NR31 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms