Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU5

PREB, Prolactin regulatory element-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREBQ9HCU5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PREBQ9HCU5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PREBQ9HCU5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PREBQ9HCU5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PREBQ9HCU5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PREBQ9HCU5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PREBQ9HCU5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PREBQ9HCU5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PREBQ9HCU5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PREBQ9HCU5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PREBQ9HCU5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PREBQ9HCU5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PREBQ9HCU5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PREBQ9HCU5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PREBQ9HCU5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PREBQ9HCU5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PREBQ9HCU5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PREBQ9HCU5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PREBQ9HCU5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PREBQ9HCU5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PREBQ9HCU5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PREBQ9HCU5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PREBQ9HCU5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PREBQ9HCU5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PREBQ9HCU5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PREBQ9HCU5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PREBQ9HCU5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PREBQ9HCU5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PREBQ9HCU5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PREBQ9HCU5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PREBQ9HCU5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PREBQ9HCU5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PREBQ9HCU5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PREBQ9HCU5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PREBQ9HCU5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PREBQ9HCU5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PREBQ9HCU5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PREBQ9HCU5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PREBQ9HCU5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PREBQ9HCU5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PREBQ9HCU5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PREBQ9HCU5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PREBQ9HCU5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PREBQ9HCU5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PREBQ9HCU5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PREBQ9HCU5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PREBQ9HCU5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PREBQ9HCU5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PREBQ9HCU5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PREBQ9HCU5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PREBQ9HCU5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PREBQ9HCU5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PREBQ9HCU5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PREBQ9HCU5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PREBQ9HCU5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PREBQ9HCU5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PREBQ9HCU5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PREBQ9HCU5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PREBQ9HCU5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PREBQ9HCU5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PREBQ9HCU5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PREBQ9HCU5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PREBQ9HCU5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PREBQ9HCU5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PREBQ9HCU5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PREBQ9HCU5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PREBQ9HCU5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PREBQ9HCU5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PREBQ9HCU5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PREBQ9HCU5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PREBQ9HCU5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PREBQ9HCU5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PREBQ9HCU5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PREBQ9HCU5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PREBQ9HCU5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PREBQ9HCU5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PREBQ9HCU5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PREBQ9HCU5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PREBQ9HCU5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PREBQ9HCU5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PREBQ9HCU5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PREBQ9HCU5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PREBQ9HCU5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PREBQ9HCU5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PREBQ9HCU5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PREBQ9HCU5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PREBQ9HCU5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PREBQ9HCU5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PREBQ9HCU5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PREBQ9HCU5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PREBQ9HCU5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PREBQ9HCU5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PREBQ9HCU5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PREBQ9HCU5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PREBQ9HCU5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PREBQ9HCU5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PREBQ9HCU5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PREBQ9HCU5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PREBQ9HCU5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PREBQ9HCU5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms