Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAZ2

PRDM16, PR domain zinc finger protein 16, humanhuman

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM16Q9HAZ2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRDM16Q9HAZ2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRDM16Q9HAZ2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
PRDM16Q9HAZ2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRDM16Q9HAZ2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRDM16Q9HAZ2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRDM16Q9HAZ2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRDM16Q9HAZ2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRDM16Q9HAZ2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRDM16Q9HAZ2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRDM16Q9HAZ2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRDM16Q9HAZ2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRDM16Q9HAZ2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRDM16Q9HAZ2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRDM16Q9HAZ2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PRDM16Q9HAZ2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRDM16Q9HAZ2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRDM16Q9HAZ2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRDM16Q9HAZ2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRDM16Q9HAZ2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRDM16Q9HAZ2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PRDM16Q9HAZ2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRDM16Q9HAZ2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRDM16Q9HAZ2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRDM16Q9HAZ2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRDM16Q9HAZ2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PRDM16Q9HAZ2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PRDM16Q9HAZ2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRDM16Q9HAZ2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRDM16Q9HAZ2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRDM16Q9HAZ2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRDM16Q9HAZ2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRDM16Q9HAZ2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRDM16Q9HAZ2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRDM16Q9HAZ2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PRDM16Q9HAZ2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRDM16Q9HAZ2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRDM16Q9HAZ2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRDM16Q9HAZ2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRDM16Q9HAZ2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PRDM16Q9HAZ2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRDM16Q9HAZ2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRDM16Q9HAZ2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRDM16Q9HAZ2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRDM16Q9HAZ2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRDM16Q9HAZ2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRDM16Q9HAZ2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRDM16Q9HAZ2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRDM16Q9HAZ2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRDM16Q9HAZ2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRDM16Q9HAZ2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRDM16Q9HAZ2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRDM16Q9HAZ2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRDM16Q9HAZ2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRDM16Q9HAZ2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PRDM16Q9HAZ2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRDM16Q9HAZ2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRDM16Q9HAZ2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRDM16Q9HAZ2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRDM16Q9HAZ2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRDM16Q9HAZ2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRDM16Q9HAZ2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRDM16Q9HAZ2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRDM16Q9HAZ2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRDM16Q9HAZ2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PRDM16Q9HAZ2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRDM16Q9HAZ2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRDM16Q9HAZ2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRDM16Q9HAZ2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRDM16Q9HAZ2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRDM16Q9HAZ2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRDM16Q9HAZ2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRDM16Q9HAZ2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRDM16Q9HAZ2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRDM16Q9HAZ2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRDM16Q9HAZ2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRDM16Q9HAZ2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRDM16Q9HAZ2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRDM16Q9HAZ2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRDM16Q9HAZ2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRDM16Q9HAZ2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PRDM16Q9HAZ2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRDM16Q9HAZ2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRDM16Q9HAZ2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRDM16Q9HAZ2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRDM16Q9HAZ2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRDM16Q9HAZ2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRDM16Q9HAZ2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRDM16Q9HAZ2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRDM16Q9HAZ2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRDM16Q9HAZ2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRDM16Q9HAZ2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRDM16Q9HAZ2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PRDM16Q9HAZ2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRDM16Q9HAZ2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRDM16Q9HAZ2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PRDM16Q9HAZ2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRDM16Q9HAZ2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRDM16Q9HAZ2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRDM16Q9HAZ2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms