Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9S5

FKRP, Fukutin-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FKRPQ9H9S5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FKRPQ9H9S5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FKRPQ9H9S5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FKRPQ9H9S5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FKRPQ9H9S5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FKRPQ9H9S5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FKRPQ9H9S5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FKRPQ9H9S5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FKRPQ9H9S5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FKRPQ9H9S5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FKRPQ9H9S5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FKRPQ9H9S5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FKRPQ9H9S5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FKRPQ9H9S5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FKRPQ9H9S5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FKRPQ9H9S5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FKRPQ9H9S5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FKRPQ9H9S5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FKRPQ9H9S5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FKRPQ9H9S5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FKRPQ9H9S5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FKRPQ9H9S5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FKRPQ9H9S5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FKRPQ9H9S5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FKRPQ9H9S5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FKRPQ9H9S5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FKRPQ9H9S5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FKRPQ9H9S5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FKRPQ9H9S5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FKRPQ9H9S5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FKRPQ9H9S5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FKRPQ9H9S5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FKRPQ9H9S5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FKRPQ9H9S5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FKRPQ9H9S5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FKRPQ9H9S5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FKRPQ9H9S5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FKRPQ9H9S5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FKRPQ9H9S5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FKRPQ9H9S5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FKRPQ9H9S5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FKRPQ9H9S5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FKRPQ9H9S5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FKRPQ9H9S5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FKRPQ9H9S5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FKRPQ9H9S5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FKRPQ9H9S5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FKRPQ9H9S5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FKRPQ9H9S5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FKRPQ9H9S5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FKRPQ9H9S5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FKRPQ9H9S5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FKRPQ9H9S5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FKRPQ9H9S5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FKRPQ9H9S5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FKRPQ9H9S5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FKRPQ9H9S5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FKRPQ9H9S5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FKRPQ9H9S5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FKRPQ9H9S5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FKRPQ9H9S5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FKRPQ9H9S5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FKRPQ9H9S5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
FKRPQ9H9S5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FKRPQ9H9S5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FKRPQ9H9S5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FKRPQ9H9S5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FKRPQ9H9S5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FKRPQ9H9S5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FKRPQ9H9S5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FKRPQ9H9S5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FKRPQ9H9S5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FKRPQ9H9S5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FKRPQ9H9S5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FKRPQ9H9S5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FKRPQ9H9S5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FKRPQ9H9S5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FKRPQ9H9S5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FKRPQ9H9S5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FKRPQ9H9S5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FKRPQ9H9S5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FKRPQ9H9S5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FKRPQ9H9S5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FKRPQ9H9S5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FKRPQ9H9S5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FKRPQ9H9S5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FKRPQ9H9S5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FKRPQ9H9S5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FKRPQ9H9S5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FKRPQ9H9S5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FKRPQ9H9S5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FKRPQ9H9S5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FKRPQ9H9S5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FKRPQ9H9S5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FKRPQ9H9S5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FKRPQ9H9S5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FKRPQ9H9S5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FKRPQ9H9S5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FKRPQ9H9S5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FKRPQ9H9S5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms