Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9K5

ERVMER34-1, Endogenous retrovirus group MER34 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVMER34-1Q9H9K5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ERVMER34-1Q9H9K5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ERVMER34-1Q9H9K5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ERVMER34-1Q9H9K5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ERVMER34-1Q9H9K5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ERVMER34-1Q9H9K5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ERVMER34-1Q9H9K5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ERVMER34-1Q9H9K5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERVMER34-1Q9H9K5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERVMER34-1Q9H9K5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERVMER34-1Q9H9K5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERVMER34-1Q9H9K5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERVMER34-1Q9H9K5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERVMER34-1Q9H9K5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERVMER34-1Q9H9K5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERVMER34-1Q9H9K5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERVMER34-1Q9H9K5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERVMER34-1Q9H9K5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERVMER34-1Q9H9K5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERVMER34-1Q9H9K5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERVMER34-1Q9H9K5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERVMER34-1Q9H9K5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERVMER34-1Q9H9K5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERVMER34-1Q9H9K5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERVMER34-1Q9H9K5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERVMER34-1Q9H9K5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERVMER34-1Q9H9K5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERVMER34-1Q9H9K5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERVMER34-1Q9H9K5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ERVMER34-1Q9H9K5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ERVMER34-1Q9H9K5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERVMER34-1Q9H9K5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERVMER34-1Q9H9K5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ERVMER34-1Q9H9K5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ERVMER34-1Q9H9K5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERVMER34-1Q9H9K5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERVMER34-1Q9H9K5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERVMER34-1Q9H9K5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERVMER34-1Q9H9K5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERVMER34-1Q9H9K5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERVMER34-1Q9H9K5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERVMER34-1Q9H9K5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERVMER34-1Q9H9K5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERVMER34-1Q9H9K5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERVMER34-1Q9H9K5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERVMER34-1Q9H9K5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERVMER34-1Q9H9K5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERVMER34-1Q9H9K5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERVMER34-1Q9H9K5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERVMER34-1Q9H9K5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERVMER34-1Q9H9K5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERVMER34-1Q9H9K5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERVMER34-1Q9H9K5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERVMER34-1Q9H9K5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERVMER34-1Q9H9K5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERVMER34-1Q9H9K5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERVMER34-1Q9H9K5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERVMER34-1Q9H9K5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERVMER34-1Q9H9K5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERVMER34-1Q9H9K5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERVMER34-1Q9H9K5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERVMER34-1Q9H9K5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERVMER34-1Q9H9K5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERVMER34-1Q9H9K5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERVMER34-1Q9H9K5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERVMER34-1Q9H9K5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERVMER34-1Q9H9K5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERVMER34-1Q9H9K5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ERVMER34-1Q9H9K5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERVMER34-1Q9H9K5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERVMER34-1Q9H9K5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERVMER34-1Q9H9K5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERVMER34-1Q9H9K5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERVMER34-1Q9H9K5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ERVMER34-1Q9H9K5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERVMER34-1Q9H9K5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERVMER34-1Q9H9K5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERVMER34-1Q9H9K5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERVMER34-1Q9H9K5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ERVMER34-1Q9H9K5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERVMER34-1Q9H9K5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERVMER34-1Q9H9K5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERVMER34-1Q9H9K5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERVMER34-1Q9H9K5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERVMER34-1Q9H9K5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERVMER34-1Q9H9K5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERVMER34-1Q9H9K5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ERVMER34-1Q9H9K5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERVMER34-1Q9H9K5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ERVMER34-1Q9H9K5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERVMER34-1Q9H9K5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERVMER34-1Q9H9K5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERVMER34-1Q9H9K5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERVMER34-1Q9H9K5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERVMER34-1Q9H9K5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERVMER34-1Q9H9K5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERVMER34-1Q9H9K5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ERVMER34-1Q9H9K5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERVMER34-1Q9H9K5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERVMER34-1Q9H9K5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms