Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8K7

C10orf88, Uncharacterized protein C10orf88, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf88Q9H8K7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
C10orf88Q9H8K7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
C10orf88Q9H8K7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
C10orf88Q9H8K7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
C10orf88Q9H8K7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
C10orf88Q9H8K7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
C10orf88Q9H8K7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
C10orf88Q9H8K7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
C10orf88Q9H8K7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
C10orf88Q9H8K7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
C10orf88Q9H8K7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
C10orf88Q9H8K7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
C10orf88Q9H8K7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
C10orf88Q9H8K7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
C10orf88Q9H8K7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
C10orf88Q9H8K7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
C10orf88Q9H8K7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
C10orf88Q9H8K7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
C10orf88Q9H8K7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
C10orf88Q9H8K7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
C10orf88Q9H8K7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
C10orf88Q9H8K7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
C10orf88Q9H8K7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
C10orf88Q9H8K7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
C10orf88Q9H8K7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
C10orf88Q9H8K7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
C10orf88Q9H8K7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
C10orf88Q9H8K7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
C10orf88Q9H8K7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
C10orf88Q9H8K7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
C10orf88Q9H8K7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
C10orf88Q9H8K7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
C10orf88Q9H8K7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
C10orf88Q9H8K7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
C10orf88Q9H8K7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
C10orf88Q9H8K7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
C10orf88Q9H8K7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
C10orf88Q9H8K7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
C10orf88Q9H8K7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
C10orf88Q9H8K7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
C10orf88Q9H8K7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
C10orf88Q9H8K7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
C10orf88Q9H8K7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
C10orf88Q9H8K7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
C10orf88Q9H8K7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
C10orf88Q9H8K7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
C10orf88Q9H8K7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
C10orf88Q9H8K7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
C10orf88Q9H8K7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
C10orf88Q9H8K7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
C10orf88Q9H8K7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
C10orf88Q9H8K7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
C10orf88Q9H8K7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
C10orf88Q9H8K7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
C10orf88Q9H8K7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
C10orf88Q9H8K7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
C10orf88Q9H8K7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
C10orf88Q9H8K7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
C10orf88Q9H8K7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
C10orf88Q9H8K7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
C10orf88Q9H8K7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
C10orf88Q9H8K7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
C10orf88Q9H8K7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
C10orf88Q9H8K7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
C10orf88Q9H8K7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
C10orf88Q9H8K7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
C10orf88Q9H8K7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
C10orf88Q9H8K7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
C10orf88Q9H8K7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
C10orf88Q9H8K7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
C10orf88Q9H8K7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
C10orf88Q9H8K7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
C10orf88Q9H8K7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
C10orf88Q9H8K7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
C10orf88Q9H8K7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
C10orf88Q9H8K7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
C10orf88Q9H8K7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
C10orf88Q9H8K7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
C10orf88Q9H8K7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
C10orf88Q9H8K7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
C10orf88Q9H8K7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
C10orf88Q9H8K7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
C10orf88Q9H8K7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
C10orf88Q9H8K7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
C10orf88Q9H8K7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
C10orf88Q9H8K7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
C10orf88Q9H8K7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
C10orf88Q9H8K7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
C10orf88Q9H8K7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
C10orf88Q9H8K7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
C10orf88Q9H8K7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
C10orf88Q9H8K7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
C10orf88Q9H8K7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
C10orf88Q9H8K7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
C10orf88Q9H8K7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
C10orf88Q9H8K7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
C10orf88Q9H8K7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
C10orf88Q9H8K7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
C10orf88Q9H8K7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
C10orf88Q9H8K7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms