Protein–RNA interactions for Protein: Q9H204

MED28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED28Q9H204 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED28Q9H204 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED28Q9H204 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED28Q9H204 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED28Q9H204 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MED28Q9H204 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
MED28Q9H204 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MED28Q9H204 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED28Q9H204 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED28Q9H204 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED28Q9H204 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED28Q9H204 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED28Q9H204 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED28Q9H204 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED28Q9H204 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED28Q9H204 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED28Q9H204 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED28Q9H204 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED28Q9H204 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED28Q9H204 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED28Q9H204 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED28Q9H204 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MED28Q9H204 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MED28Q9H204 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MED28Q9H204 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MED28Q9H204 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MED28Q9H204 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MED28Q9H204 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MED28Q9H204 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED28Q9H204 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED28Q9H204 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED28Q9H204 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED28Q9H204 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED28Q9H204 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MED28Q9H204 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MED28Q9H204 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MED28Q9H204 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MED28Q9H204 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MED28Q9H204 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MED28Q9H204 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MED28Q9H204 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MED28Q9H204 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MED28Q9H204 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MED28Q9H204 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MED28Q9H204 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MED28Q9H204 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MED28Q9H204 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MED28Q9H204 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MED28Q9H204 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MED28Q9H204 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MED28Q9H204 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MED28Q9H204 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MED28Q9H204 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MED28Q9H204 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MED28Q9H204 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MED28Q9H204 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MED28Q9H204 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MED28Q9H204 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MED28Q9H204 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MED28Q9H204 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MED28Q9H204 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MED28Q9H204 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MED28Q9H204 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MED28Q9H204 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MED28Q9H204 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MED28Q9H204 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MED28Q9H204 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MED28Q9H204 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED28Q9H204 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED28Q9H204 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED28Q9H204 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED28Q9H204 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MED28Q9H204 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MED28Q9H204 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MED28Q9H204 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MED28Q9H204 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MED28Q9H204 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MED28Q9H204 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MED28Q9H204 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MED28Q9H204 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MED28Q9H204 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MED28Q9H204 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MED28Q9H204 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MED28Q9H204 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MED28Q9H204 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MED28Q9H204 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MED28Q9H204 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MED28Q9H204 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
MED28Q9H204 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MED28Q9H204 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MED28Q9H204 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MED28Q9H204 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MED28Q9H204 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MED28Q9H204 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MED28Q9H204 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MED28Q9H204 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MED28Q9H204 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MED28Q9H204 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MED28Q9H204 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MED28Q9H204 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms