Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W8

SMG9, Protein SMG9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG9Q9H0W8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMG9Q9H0W8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMG9Q9H0W8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMG9Q9H0W8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMG9Q9H0W8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMG9Q9H0W8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMG9Q9H0W8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMG9Q9H0W8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SMG9Q9H0W8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMG9Q9H0W8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMG9Q9H0W8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMG9Q9H0W8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMG9Q9H0W8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SMG9Q9H0W8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMG9Q9H0W8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMG9Q9H0W8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMG9Q9H0W8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMG9Q9H0W8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMG9Q9H0W8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMG9Q9H0W8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMG9Q9H0W8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SMG9Q9H0W8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMG9Q9H0W8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMG9Q9H0W8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMG9Q9H0W8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMG9Q9H0W8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMG9Q9H0W8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMG9Q9H0W8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMG9Q9H0W8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMG9Q9H0W8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMG9Q9H0W8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMG9Q9H0W8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMG9Q9H0W8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMG9Q9H0W8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMG9Q9H0W8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SMG9Q9H0W8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMG9Q9H0W8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMG9Q9H0W8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMG9Q9H0W8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMG9Q9H0W8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMG9Q9H0W8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMG9Q9H0W8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMG9Q9H0W8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMG9Q9H0W8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SMG9Q9H0W8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMG9Q9H0W8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMG9Q9H0W8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMG9Q9H0W8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMG9Q9H0W8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMG9Q9H0W8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMG9Q9H0W8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMG9Q9H0W8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMG9Q9H0W8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMG9Q9H0W8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMG9Q9H0W8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMG9Q9H0W8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMG9Q9H0W8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMG9Q9H0W8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMG9Q9H0W8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMG9Q9H0W8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMG9Q9H0W8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SMG9Q9H0W8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMG9Q9H0W8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMG9Q9H0W8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMG9Q9H0W8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMG9Q9H0W8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMG9Q9H0W8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMG9Q9H0W8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMG9Q9H0W8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMG9Q9H0W8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMG9Q9H0W8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMG9Q9H0W8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMG9Q9H0W8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMG9Q9H0W8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMG9Q9H0W8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMG9Q9H0W8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMG9Q9H0W8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMG9Q9H0W8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMG9Q9H0W8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMG9Q9H0W8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMG9Q9H0W8 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SMG9Q9H0W8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SMG9Q9H0W8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMG9Q9H0W8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMG9Q9H0W8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMG9Q9H0W8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMG9Q9H0W8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMG9Q9H0W8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMG9Q9H0W8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMG9Q9H0W8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMG9Q9H0W8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMG9Q9H0W8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMG9Q9H0W8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMG9Q9H0W8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMG9Q9H0W8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMG9Q9H0W8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMG9Q9H0W8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMG9Q9H0W8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMG9Q9H0W8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMG9Q9H0W8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms