Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN0

GPR88, Probable G-protein coupled receptor 88, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR88Q9GZN0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GPR88Q9GZN0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GPR88Q9GZN0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GPR88Q9GZN0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GPR88Q9GZN0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GPR88Q9GZN0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
GPR88Q9GZN0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
GPR88Q9GZN0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GPR88Q9GZN0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GPR88Q9GZN0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GPR88Q9GZN0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GPR88Q9GZN0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GPR88Q9GZN0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GPR88Q9GZN0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
GPR88Q9GZN0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GPR88Q9GZN0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GPR88Q9GZN0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GPR88Q9GZN0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GPR88Q9GZN0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GPR88Q9GZN0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GPR88Q9GZN0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GPR88Q9GZN0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GPR88Q9GZN0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GPR88Q9GZN0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GPR88Q9GZN0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GPR88Q9GZN0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
GPR88Q9GZN0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GPR88Q9GZN0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GPR88Q9GZN0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GPR88Q9GZN0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
GPR88Q9GZN0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GPR88Q9GZN0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GPR88Q9GZN0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GPR88Q9GZN0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GPR88Q9GZN0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GPR88Q9GZN0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GPR88Q9GZN0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GPR88Q9GZN0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GPR88Q9GZN0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
GPR88Q9GZN0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GPR88Q9GZN0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GPR88Q9GZN0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GPR88Q9GZN0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GPR88Q9GZN0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GPR88Q9GZN0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GPR88Q9GZN0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GPR88Q9GZN0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GPR88Q9GZN0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GPR88Q9GZN0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GPR88Q9GZN0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GPR88Q9GZN0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GPR88Q9GZN0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GPR88Q9GZN0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GPR88Q9GZN0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GPR88Q9GZN0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GPR88Q9GZN0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GPR88Q9GZN0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GPR88Q9GZN0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GPR88Q9GZN0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
GPR88Q9GZN0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GPR88Q9GZN0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GPR88Q9GZN0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GPR88Q9GZN0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GPR88Q9GZN0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GPR88Q9GZN0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GPR88Q9GZN0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GPR88Q9GZN0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GPR88Q9GZN0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GPR88Q9GZN0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GPR88Q9GZN0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GPR88Q9GZN0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GPR88Q9GZN0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GPR88Q9GZN0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GPR88Q9GZN0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GPR88Q9GZN0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GPR88Q9GZN0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GPR88Q9GZN0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
GPR88Q9GZN0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GPR88Q9GZN0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GPR88Q9GZN0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GPR88Q9GZN0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GPR88Q9GZN0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GPR88Q9GZN0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GPR88Q9GZN0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GPR88Q9GZN0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GPR88Q9GZN0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GPR88Q9GZN0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
GPR88Q9GZN0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GPR88Q9GZN0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GPR88Q9GZN0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GPR88Q9GZN0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GPR88Q9GZN0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GPR88Q9GZN0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
GPR88Q9GZN0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GPR88Q9GZN0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GPR88Q9GZN0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GPR88Q9GZN0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GPR88Q9GZN0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GPR88Q9GZN0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GPR88Q9GZN0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms