Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEMA4CQ9C0C4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEMA4CQ9C0C4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEMA4CQ9C0C4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEMA4CQ9C0C4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEMA4CQ9C0C4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEMA4CQ9C0C4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEMA4CQ9C0C4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEMA4CQ9C0C4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEMA4CQ9C0C4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEMA4CQ9C0C4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEMA4CQ9C0C4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEMA4CQ9C0C4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA4CQ9C0C4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA4CQ9C0C4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA4CQ9C0C4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA4CQ9C0C4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA4CQ9C0C4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA4CQ9C0C4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA4CQ9C0C4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA4CQ9C0C4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA4CQ9C0C4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA4CQ9C0C4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA4CQ9C0C4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA4CQ9C0C4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA4CQ9C0C4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA4CQ9C0C4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEMA4CQ9C0C4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEMA4CQ9C0C4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEMA4CQ9C0C4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEMA4CQ9C0C4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEMA4CQ9C0C4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEMA4CQ9C0C4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SEMA4CQ9C0C4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SEMA4CQ9C0C4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SEMA4CQ9C0C4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SEMA4CQ9C0C4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEMA4CQ9C0C4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEMA4CQ9C0C4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEMA4CQ9C0C4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEMA4CQ9C0C4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEMA4CQ9C0C4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEMA4CQ9C0C4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEMA4CQ9C0C4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEMA4CQ9C0C4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEMA4CQ9C0C4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEMA4CQ9C0C4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEMA4CQ9C0C4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEMA4CQ9C0C4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEMA4CQ9C0C4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEMA4CQ9C0C4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SEMA4CQ9C0C4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEMA4CQ9C0C4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEMA4CQ9C0C4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEMA4CQ9C0C4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEMA4CQ9C0C4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEMA4CQ9C0C4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEMA4CQ9C0C4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEMA4CQ9C0C4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEMA4CQ9C0C4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEMA4CQ9C0C4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEMA4CQ9C0C4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEMA4CQ9C0C4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEMA4CQ9C0C4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEMA4CQ9C0C4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEMA4CQ9C0C4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEMA4CQ9C0C4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEMA4CQ9C0C4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEMA4CQ9C0C4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEMA4CQ9C0C4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEMA4CQ9C0C4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SEMA4CQ9C0C4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEMA4CQ9C0C4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEMA4CQ9C0C4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEMA4CQ9C0C4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA4CQ9C0C4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA4CQ9C0C4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA4CQ9C0C4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA4CQ9C0C4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA4CQ9C0C4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA4CQ9C0C4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA4CQ9C0C4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA4CQ9C0C4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA4CQ9C0C4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA4CQ9C0C4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA4CQ9C0C4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA4CQ9C0C4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA4CQ9C0C4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA4CQ9C0C4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA4CQ9C0C4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA4CQ9C0C4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA4CQ9C0C4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA4CQ9C0C4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA4CQ9C0C4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA4CQ9C0C4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA4CQ9C0C4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA4CQ9C0C4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA4CQ9C0C4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA4CQ9C0C4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA4CQ9C0C4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms