Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZM3

GSX2, GS homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSX2Q9BZM3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSX2Q9BZM3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSX2Q9BZM3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GSX2Q9BZM3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GSX2Q9BZM3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GSX2Q9BZM3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GSX2Q9BZM3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GSX2Q9BZM3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GSX2Q9BZM3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GSX2Q9BZM3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GSX2Q9BZM3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GSX2Q9BZM3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSX2Q9BZM3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSX2Q9BZM3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSX2Q9BZM3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSX2Q9BZM3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSX2Q9BZM3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSX2Q9BZM3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSX2Q9BZM3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSX2Q9BZM3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSX2Q9BZM3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSX2Q9BZM3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSX2Q9BZM3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSX2Q9BZM3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSX2Q9BZM3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSX2Q9BZM3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GSX2Q9BZM3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GSX2Q9BZM3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GSX2Q9BZM3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GSX2Q9BZM3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GSX2Q9BZM3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GSX2Q9BZM3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GSX2Q9BZM3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GSX2Q9BZM3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSX2Q9BZM3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSX2Q9BZM3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSX2Q9BZM3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSX2Q9BZM3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSX2Q9BZM3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GSX2Q9BZM3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GSX2Q9BZM3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GSX2Q9BZM3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSX2Q9BZM3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSX2Q9BZM3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GSX2Q9BZM3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GSX2Q9BZM3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GSX2Q9BZM3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GSX2Q9BZM3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GSX2Q9BZM3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GSX2Q9BZM3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GSX2Q9BZM3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GSX2Q9BZM3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GSX2Q9BZM3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GSX2Q9BZM3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GSX2Q9BZM3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GSX2Q9BZM3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GSX2Q9BZM3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GSX2Q9BZM3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GSX2Q9BZM3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GSX2Q9BZM3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GSX2Q9BZM3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GSX2Q9BZM3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GSX2Q9BZM3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GSX2Q9BZM3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GSX2Q9BZM3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GSX2Q9BZM3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GSX2Q9BZM3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GSX2Q9BZM3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GSX2Q9BZM3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GSX2Q9BZM3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GSX2Q9BZM3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GSX2Q9BZM3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GSX2Q9BZM3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GSX2Q9BZM3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GSX2Q9BZM3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GSX2Q9BZM3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GSX2Q9BZM3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GSX2Q9BZM3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GSX2Q9BZM3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GSX2Q9BZM3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GSX2Q9BZM3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GSX2Q9BZM3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GSX2Q9BZM3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GSX2Q9BZM3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GSX2Q9BZM3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GSX2Q9BZM3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GSX2Q9BZM3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GSX2Q9BZM3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GSX2Q9BZM3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GSX2Q9BZM3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GSX2Q9BZM3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GSX2Q9BZM3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GSX2Q9BZM3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GSX2Q9BZM3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GSX2Q9BZM3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GSX2Q9BZM3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GSX2Q9BZM3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GSX2Q9BZM3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GSX2Q9BZM3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GSX2Q9BZM3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 216.5 ms