Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS1

KRTAP1-5, Keratin-associated protein 1-5, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-5Q9BYS1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
KRTAP1-5Q9BYS1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
KRTAP1-5Q9BYS1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
KRTAP1-5Q9BYS1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
KRTAP1-5Q9BYS1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
KRTAP1-5Q9BYS1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
KRTAP1-5Q9BYS1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
KRTAP1-5Q9BYS1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
KRTAP1-5Q9BYS1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KRTAP1-5Q9BYS1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KRTAP1-5Q9BYS1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRTAP1-5Q9BYS1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
KRTAP1-5Q9BYS1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRTAP1-5Q9BYS1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KRTAP1-5Q9BYS1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRTAP1-5Q9BYS1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRTAP1-5Q9BYS1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KRTAP1-5Q9BYS1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KRTAP1-5Q9BYS1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KRTAP1-5Q9BYS1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KRTAP1-5Q9BYS1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRTAP1-5Q9BYS1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRTAP1-5Q9BYS1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRTAP1-5Q9BYS1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRTAP1-5Q9BYS1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRTAP1-5Q9BYS1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRTAP1-5Q9BYS1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRTAP1-5Q9BYS1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRTAP1-5Q9BYS1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRTAP1-5Q9BYS1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRTAP1-5Q9BYS1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
KRTAP1-5Q9BYS1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRTAP1-5Q9BYS1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRTAP1-5Q9BYS1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRTAP1-5Q9BYS1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRTAP1-5Q9BYS1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRTAP1-5Q9BYS1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRTAP1-5Q9BYS1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
KRTAP1-5Q9BYS1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRTAP1-5Q9BYS1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRTAP1-5Q9BYS1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRTAP1-5Q9BYS1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRTAP1-5Q9BYS1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRTAP1-5Q9BYS1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRTAP1-5Q9BYS1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRTAP1-5Q9BYS1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRTAP1-5Q9BYS1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
KRTAP1-5Q9BYS1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms