Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
KDM5DQ9BY66 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC39.19■■■■□ 3.86
KDM5DQ9BY66 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
KDM5DQ9BY66 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC39.16■■■■□ 3.86
KDM5DQ9BY66 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
KDM5DQ9BY66 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
KDM5DQ9BY66 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC39.14■■■■□ 3.86
KDM5DQ9BY66 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
KDM5DQ9BY66 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.13■■■■□ 3.85
KDM5DQ9BY66 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
KDM5DQ9BY66 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
KDM5DQ9BY66 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.1■■■■□ 3.85
KDM5DQ9BY66 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
KDM5DQ9BY66 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
KDM5DQ9BY66 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
KDM5DQ9BY66 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
KDM5DQ9BY66 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC39.08■■■■□ 3.85
KDM5DQ9BY66 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC39.07■■■■□ 3.84
KDM5DQ9BY66 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC39.06■■■■□ 3.84
KDM5DQ9BY66 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
KDM5DQ9BY66 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC39.06■■■■□ 3.84
KDM5DQ9BY66 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.06■■■■□ 3.84
KDM5DQ9BY66 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
KDM5DQ9BY66 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
KDM5DQ9BY66 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
KDM5DQ9BY66 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC39.04■■■■□ 3.84
KDM5DQ9BY66 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
KDM5DQ9BY66 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
KDM5DQ9BY66 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC39.02■■■■□ 3.84
KDM5DQ9BY66 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC39.01■■■■□ 3.84
KDM5DQ9BY66 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
KDM5DQ9BY66 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
KDM5DQ9BY66 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC39■■■■□ 3.83
KDM5DQ9BY66 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC39■■■■□ 3.83
KDM5DQ9BY66 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
KDM5DQ9BY66 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
KDM5DQ9BY66 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
KDM5DQ9BY66 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC38.98■■■■□ 3.83
KDM5DQ9BY66 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC38.98■■■■□ 3.83
KDM5DQ9BY66 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC38.98■■■■□ 3.83
KDM5DQ9BY66 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
KDM5DQ9BY66 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC38.95■■■■□ 3.83
KDM5DQ9BY66 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC38.95■■■■□ 3.83
KDM5DQ9BY66 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
KDM5DQ9BY66 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
KDM5DQ9BY66 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
KDM5DQ9BY66 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
KDM5DQ9BY66 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC38.92■■■■□ 3.82
KDM5DQ9BY66 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.91■■■■□ 3.82
KDM5DQ9BY66 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
KDM5DQ9BY66 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.91■■■■□ 3.82
KDM5DQ9BY66 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
KDM5DQ9BY66 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
KDM5DQ9BY66 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC38.9■■■■□ 3.82
KDM5DQ9BY66 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC38.9■■■■□ 3.82
KDM5DQ9BY66 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
KDM5DQ9BY66 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
KDM5DQ9BY66 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC38.87■■■■□ 3.81
KDM5DQ9BY66 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC38.86■■■■□ 3.81
KDM5DQ9BY66 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
KDM5DQ9BY66 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
KDM5DQ9BY66 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC38.85■■■■□ 3.81
KDM5DQ9BY66 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
KDM5DQ9BY66 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
KDM5DQ9BY66 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
KDM5DQ9BY66 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC38.84■■■■□ 3.81
KDM5DQ9BY66 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
KDM5DQ9BY66 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC38.82■■■■□ 3.8
KDM5DQ9BY66 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC38.82■■■■□ 3.8
KDM5DQ9BY66 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.81■■■■□ 3.8
KDM5DQ9BY66 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
KDM5DQ9BY66 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
KDM5DQ9BY66 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC38.79■■■■□ 3.8
KDM5DQ9BY66 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
KDM5DQ9BY66 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
KDM5DQ9BY66 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
KDM5DQ9BY66 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.79
KDM5DQ9BY66 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC38.76■■■■□ 3.79
KDM5DQ9BY66 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC38.75■■■■□ 3.79
KDM5DQ9BY66 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
KDM5DQ9BY66 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
KDM5DQ9BY66 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
KDM5DQ9BY66 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
KDM5DQ9BY66 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
KDM5DQ9BY66 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
KDM5DQ9BY66 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC38.73■■■■□ 3.79
KDM5DQ9BY66 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
KDM5DQ9BY66 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
KDM5DQ9BY66 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.71■■■■□ 3.79
KDM5DQ9BY66 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
KDM5DQ9BY66 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
KDM5DQ9BY66 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.71■■■■□ 3.79
KDM5DQ9BY66 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
KDM5DQ9BY66 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
KDM5DQ9BY66 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC38.7■■■■□ 3.79
KDM5DQ9BY66 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC38.7■■■■□ 3.79
KDM5DQ9BY66 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
KDM5DQ9BY66 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
KDM5DQ9BY66 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
KDM5DQ9BY66 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms