Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC94Q9BW85 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC94Q9BW85 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC94Q9BW85 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC94Q9BW85 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC94Q9BW85 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC94Q9BW85 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC94Q9BW85 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC94Q9BW85 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC94Q9BW85 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC94Q9BW85 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC94Q9BW85 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC94Q9BW85 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC94Q9BW85 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC94Q9BW85 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC94Q9BW85 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC94Q9BW85 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC94Q9BW85 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC94Q9BW85 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC94Q9BW85 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC94Q9BW85 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC94Q9BW85 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC94Q9BW85 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC94Q9BW85 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC94Q9BW85 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC94Q9BW85 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC94Q9BW85 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC94Q9BW85 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC94Q9BW85 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC94Q9BW85 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC94Q9BW85 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC94Q9BW85 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC94Q9BW85 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC94Q9BW85 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC94Q9BW85 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC94Q9BW85 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC94Q9BW85 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC94Q9BW85 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC94Q9BW85 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC94Q9BW85 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC94Q9BW85 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC94Q9BW85 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC94Q9BW85 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC94Q9BW85 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC94Q9BW85 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC94Q9BW85 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC94Q9BW85 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC94Q9BW85 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC94Q9BW85 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC94Q9BW85 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC94Q9BW85 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC94Q9BW85 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC94Q9BW85 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC94Q9BW85 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC94Q9BW85 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC94Q9BW85 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC94Q9BW85 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC94Q9BW85 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC94Q9BW85 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC94Q9BW85 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC94Q9BW85 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC94Q9BW85 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC94Q9BW85 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC94Q9BW85 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC94Q9BW85 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC94Q9BW85 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC94Q9BW85 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC94Q9BW85 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC94Q9BW85 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC94Q9BW85 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC94Q9BW85 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC94Q9BW85 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC94Q9BW85 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC94Q9BW85 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC94Q9BW85 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC94Q9BW85 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC94Q9BW85 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC94Q9BW85 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC94Q9BW85 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC94Q9BW85 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC94Q9BW85 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC94Q9BW85 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC94Q9BW85 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC94Q9BW85 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC94Q9BW85 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC94Q9BW85 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC94Q9BW85 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC94Q9BW85 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC94Q9BW85 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC94Q9BW85 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC94Q9BW85 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC94Q9BW85 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC94Q9BW85 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC94Q9BW85 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC94Q9BW85 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC94Q9BW85 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC94Q9BW85 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC94Q9BW85 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC94Q9BW85 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC94Q9BW85 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms