Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C9orf16Q9BUW7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C9orf16Q9BUW7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C9orf16Q9BUW7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C9orf16Q9BUW7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C9orf16Q9BUW7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C9orf16Q9BUW7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C9orf16Q9BUW7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C9orf16Q9BUW7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C9orf16Q9BUW7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C9orf16Q9BUW7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C9orf16Q9BUW7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C9orf16Q9BUW7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C9orf16Q9BUW7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C9orf16Q9BUW7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C9orf16Q9BUW7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C9orf16Q9BUW7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C9orf16Q9BUW7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C9orf16Q9BUW7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C9orf16Q9BUW7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
C9orf16Q9BUW7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C9orf16Q9BUW7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C9orf16Q9BUW7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C9orf16Q9BUW7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C9orf16Q9BUW7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C9orf16Q9BUW7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C9orf16Q9BUW7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C9orf16Q9BUW7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C9orf16Q9BUW7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C9orf16Q9BUW7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C9orf16Q9BUW7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C9orf16Q9BUW7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C9orf16Q9BUW7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C9orf16Q9BUW7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C9orf16Q9BUW7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C9orf16Q9BUW7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C9orf16Q9BUW7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C9orf16Q9BUW7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C9orf16Q9BUW7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C9orf16Q9BUW7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C9orf16Q9BUW7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C9orf16Q9BUW7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C9orf16Q9BUW7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C9orf16Q9BUW7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
C9orf16Q9BUW7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C9orf16Q9BUW7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
C9orf16Q9BUW7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C9orf16Q9BUW7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C9orf16Q9BUW7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C9orf16Q9BUW7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C9orf16Q9BUW7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C9orf16Q9BUW7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C9orf16Q9BUW7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C9orf16Q9BUW7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C9orf16Q9BUW7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C9orf16Q9BUW7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C9orf16Q9BUW7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C9orf16Q9BUW7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C9orf16Q9BUW7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C9orf16Q9BUW7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C9orf16Q9BUW7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C9orf16Q9BUW7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C9orf16Q9BUW7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C9orf16Q9BUW7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C9orf16Q9BUW7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C9orf16Q9BUW7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C9orf16Q9BUW7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
C9orf16Q9BUW7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C9orf16Q9BUW7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C9orf16Q9BUW7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C9orf16Q9BUW7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C9orf16Q9BUW7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C9orf16Q9BUW7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C9orf16Q9BUW7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C9orf16Q9BUW7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C9orf16Q9BUW7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C9orf16Q9BUW7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C9orf16Q9BUW7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C9orf16Q9BUW7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C9orf16Q9BUW7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C9orf16Q9BUW7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C9orf16Q9BUW7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
C9orf16Q9BUW7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C9orf16Q9BUW7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C9orf16Q9BUW7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C9orf16Q9BUW7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C9orf16Q9BUW7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C9orf16Q9BUW7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
C9orf16Q9BUW7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C9orf16Q9BUW7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C9orf16Q9BUW7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C9orf16Q9BUW7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C9orf16Q9BUW7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C9orf16Q9BUW7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C9orf16Q9BUW7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C9orf16Q9BUW7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C9orf16Q9BUW7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C9orf16Q9BUW7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
C9orf16Q9BUW7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C9orf16Q9BUW7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms