Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HERPUD2Q9BSE4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HERPUD2Q9BSE4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HERPUD2Q9BSE4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HERPUD2Q9BSE4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HERPUD2Q9BSE4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HERPUD2Q9BSE4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HERPUD2Q9BSE4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
HERPUD2Q9BSE4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HERPUD2Q9BSE4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HERPUD2Q9BSE4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HERPUD2Q9BSE4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HERPUD2Q9BSE4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HERPUD2Q9BSE4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HERPUD2Q9BSE4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HERPUD2Q9BSE4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HERPUD2Q9BSE4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HERPUD2Q9BSE4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HERPUD2Q9BSE4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HERPUD2Q9BSE4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HERPUD2Q9BSE4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HERPUD2Q9BSE4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
HERPUD2Q9BSE4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
HERPUD2Q9BSE4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HERPUD2Q9BSE4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HERPUD2Q9BSE4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
HERPUD2Q9BSE4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HERPUD2Q9BSE4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HERPUD2Q9BSE4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HERPUD2Q9BSE4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HERPUD2Q9BSE4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HERPUD2Q9BSE4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HERPUD2Q9BSE4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HERPUD2Q9BSE4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HERPUD2Q9BSE4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HERPUD2Q9BSE4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HERPUD2Q9BSE4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HERPUD2Q9BSE4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HERPUD2Q9BSE4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HERPUD2Q9BSE4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HERPUD2Q9BSE4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
HERPUD2Q9BSE4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HERPUD2Q9BSE4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HERPUD2Q9BSE4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HERPUD2Q9BSE4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HERPUD2Q9BSE4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HERPUD2Q9BSE4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HERPUD2Q9BSE4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HERPUD2Q9BSE4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
HERPUD2Q9BSE4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HERPUD2Q9BSE4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HERPUD2Q9BSE4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HERPUD2Q9BSE4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HERPUD2Q9BSE4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HERPUD2Q9BSE4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HERPUD2Q9BSE4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HERPUD2Q9BSE4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HERPUD2Q9BSE4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HERPUD2Q9BSE4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HERPUD2Q9BSE4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HERPUD2Q9BSE4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
HERPUD2Q9BSE4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HERPUD2Q9BSE4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HERPUD2Q9BSE4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HERPUD2Q9BSE4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HERPUD2Q9BSE4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HERPUD2Q9BSE4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
HERPUD2Q9BSE4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HERPUD2Q9BSE4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HERPUD2Q9BSE4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HERPUD2Q9BSE4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HERPUD2Q9BSE4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HERPUD2Q9BSE4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HERPUD2Q9BSE4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HERPUD2Q9BSE4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HERPUD2Q9BSE4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HERPUD2Q9BSE4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HERPUD2Q9BSE4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HERPUD2Q9BSE4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HERPUD2Q9BSE4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HERPUD2Q9BSE4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HERPUD2Q9BSE4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HERPUD2Q9BSE4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HERPUD2Q9BSE4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HERPUD2Q9BSE4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HERPUD2Q9BSE4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HERPUD2Q9BSE4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HERPUD2Q9BSE4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HERPUD2Q9BSE4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HERPUD2Q9BSE4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HERPUD2Q9BSE4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HERPUD2Q9BSE4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HERPUD2Q9BSE4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HERPUD2Q9BSE4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HERPUD2Q9BSE4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HERPUD2Q9BSE4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HERPUD2Q9BSE4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HERPUD2Q9BSE4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HERPUD2Q9BSE4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
HERPUD2Q9BSE4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms