Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRA2

TXNDC17, Thioredoxin domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC17Q9BRA2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TXNDC17Q9BRA2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TXNDC17Q9BRA2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TXNDC17Q9BRA2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TXNDC17Q9BRA2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TXNDC17Q9BRA2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TXNDC17Q9BRA2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TXNDC17Q9BRA2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TXNDC17Q9BRA2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TXNDC17Q9BRA2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TXNDC17Q9BRA2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TXNDC17Q9BRA2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TXNDC17Q9BRA2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TXNDC17Q9BRA2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TXNDC17Q9BRA2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TXNDC17Q9BRA2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TXNDC17Q9BRA2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TXNDC17Q9BRA2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TXNDC17Q9BRA2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TXNDC17Q9BRA2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TXNDC17Q9BRA2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TXNDC17Q9BRA2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TXNDC17Q9BRA2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TXNDC17Q9BRA2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TXNDC17Q9BRA2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TXNDC17Q9BRA2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TXNDC17Q9BRA2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TXNDC17Q9BRA2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TXNDC17Q9BRA2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TXNDC17Q9BRA2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TXNDC17Q9BRA2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TXNDC17Q9BRA2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TXNDC17Q9BRA2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TXNDC17Q9BRA2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TXNDC17Q9BRA2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TXNDC17Q9BRA2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TXNDC17Q9BRA2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TXNDC17Q9BRA2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TXNDC17Q9BRA2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TXNDC17Q9BRA2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TXNDC17Q9BRA2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TXNDC17Q9BRA2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TXNDC17Q9BRA2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TXNDC17Q9BRA2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TXNDC17Q9BRA2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TXNDC17Q9BRA2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TXNDC17Q9BRA2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TXNDC17Q9BRA2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TXNDC17Q9BRA2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TXNDC17Q9BRA2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TXNDC17Q9BRA2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TXNDC17Q9BRA2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TXNDC17Q9BRA2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TXNDC17Q9BRA2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TXNDC17Q9BRA2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TXNDC17Q9BRA2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TXNDC17Q9BRA2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TXNDC17Q9BRA2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TXNDC17Q9BRA2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TXNDC17Q9BRA2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TXNDC17Q9BRA2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TXNDC17Q9BRA2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TXNDC17Q9BRA2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TXNDC17Q9BRA2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TXNDC17Q9BRA2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TXNDC17Q9BRA2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TXNDC17Q9BRA2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TXNDC17Q9BRA2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TXNDC17Q9BRA2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TXNDC17Q9BRA2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TXNDC17Q9BRA2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TXNDC17Q9BRA2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TXNDC17Q9BRA2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TXNDC17Q9BRA2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TXNDC17Q9BRA2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TXNDC17Q9BRA2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TXNDC17Q9BRA2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TXNDC17Q9BRA2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TXNDC17Q9BRA2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TXNDC17Q9BRA2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TXNDC17Q9BRA2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TXNDC17Q9BRA2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TXNDC17Q9BRA2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TXNDC17Q9BRA2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TXNDC17Q9BRA2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TXNDC17Q9BRA2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TXNDC17Q9BRA2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TXNDC17Q9BRA2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TXNDC17Q9BRA2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
TXNDC17Q9BRA2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TXNDC17Q9BRA2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TXNDC17Q9BRA2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TXNDC17Q9BRA2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TXNDC17Q9BRA2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TXNDC17Q9BRA2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TXNDC17Q9BRA2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TXNDC17Q9BRA2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TXNDC17Q9BRA2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TXNDC17Q9BRA2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TXNDC17Q9BRA2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms