Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ75

CMSS1, Protein CMSS1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMSS1Q9BQ75 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CMSS1Q9BQ75 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CMSS1Q9BQ75 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CMSS1Q9BQ75 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CMSS1Q9BQ75 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CMSS1Q9BQ75 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CMSS1Q9BQ75 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CMSS1Q9BQ75 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CMSS1Q9BQ75 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CMSS1Q9BQ75 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CMSS1Q9BQ75 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CMSS1Q9BQ75 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CMSS1Q9BQ75 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CMSS1Q9BQ75 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CMSS1Q9BQ75 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CMSS1Q9BQ75 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CMSS1Q9BQ75 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CMSS1Q9BQ75 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CMSS1Q9BQ75 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CMSS1Q9BQ75 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CMSS1Q9BQ75 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CMSS1Q9BQ75 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CMSS1Q9BQ75 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CMSS1Q9BQ75 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CMSS1Q9BQ75 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CMSS1Q9BQ75 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CMSS1Q9BQ75 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CMSS1Q9BQ75 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CMSS1Q9BQ75 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CMSS1Q9BQ75 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CMSS1Q9BQ75 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CMSS1Q9BQ75 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CMSS1Q9BQ75 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CMSS1Q9BQ75 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CMSS1Q9BQ75 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CMSS1Q9BQ75 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CMSS1Q9BQ75 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CMSS1Q9BQ75 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CMSS1Q9BQ75 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CMSS1Q9BQ75 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CMSS1Q9BQ75 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CMSS1Q9BQ75 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CMSS1Q9BQ75 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CMSS1Q9BQ75 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CMSS1Q9BQ75 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CMSS1Q9BQ75 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CMSS1Q9BQ75 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CMSS1Q9BQ75 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CMSS1Q9BQ75 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CMSS1Q9BQ75 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CMSS1Q9BQ75 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CMSS1Q9BQ75 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CMSS1Q9BQ75 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CMSS1Q9BQ75 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CMSS1Q9BQ75 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CMSS1Q9BQ75 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CMSS1Q9BQ75 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CMSS1Q9BQ75 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CMSS1Q9BQ75 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CMSS1Q9BQ75 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CMSS1Q9BQ75 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CMSS1Q9BQ75 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CMSS1Q9BQ75 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CMSS1Q9BQ75 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CMSS1Q9BQ75 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CMSS1Q9BQ75 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CMSS1Q9BQ75 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CMSS1Q9BQ75 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CMSS1Q9BQ75 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CMSS1Q9BQ75 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CMSS1Q9BQ75 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CMSS1Q9BQ75 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CMSS1Q9BQ75 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CMSS1Q9BQ75 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CMSS1Q9BQ75 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CMSS1Q9BQ75 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CMSS1Q9BQ75 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CMSS1Q9BQ75 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CMSS1Q9BQ75 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CMSS1Q9BQ75 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CMSS1Q9BQ75 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CMSS1Q9BQ75 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CMSS1Q9BQ75 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CMSS1Q9BQ75 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CMSS1Q9BQ75 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CMSS1Q9BQ75 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CMSS1Q9BQ75 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CMSS1Q9BQ75 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CMSS1Q9BQ75 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CMSS1Q9BQ75 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CMSS1Q9BQ75 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CMSS1Q9BQ75 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CMSS1Q9BQ75 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CMSS1Q9BQ75 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CMSS1Q9BQ75 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CMSS1Q9BQ75 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CMSS1Q9BQ75 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CMSS1Q9BQ75 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CMSS1Q9BQ75 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CMSS1Q9BQ75 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms