Protein–RNA interactions for Protein: Q99829

CPNE1, Copine-1, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE1Q99829 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CPNE1Q99829 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CPNE1Q99829 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CPNE1Q99829 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CPNE1Q99829 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CPNE1Q99829 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CPNE1Q99829 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CPNE1Q99829 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CPNE1Q99829 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CPNE1Q99829 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CPNE1Q99829 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CPNE1Q99829 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CPNE1Q99829 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CPNE1Q99829 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CPNE1Q99829 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CPNE1Q99829 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CPNE1Q99829 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CPNE1Q99829 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CPNE1Q99829 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CPNE1Q99829 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CPNE1Q99829 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CPNE1Q99829 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CPNE1Q99829 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CPNE1Q99829 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CPNE1Q99829 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CPNE1Q99829 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CPNE1Q99829 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CPNE1Q99829 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CPNE1Q99829 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CPNE1Q99829 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CPNE1Q99829 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CPNE1Q99829 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CPNE1Q99829 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CPNE1Q99829 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CPNE1Q99829 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CPNE1Q99829 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CPNE1Q99829 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CPNE1Q99829 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CPNE1Q99829 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CPNE1Q99829 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CPNE1Q99829 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CPNE1Q99829 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CPNE1Q99829 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CPNE1Q99829 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CPNE1Q99829 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CPNE1Q99829 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CPNE1Q99829 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CPNE1Q99829 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CPNE1Q99829 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CPNE1Q99829 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CPNE1Q99829 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CPNE1Q99829 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CPNE1Q99829 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPNE1Q99829 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPNE1Q99829 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPNE1Q99829 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CPNE1Q99829 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.72
CPNE1Q99829 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CPNE1Q99829 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CPNE1Q99829 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CPNE1Q99829 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CPNE1Q99829 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CPNE1Q99829 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CPNE1Q99829 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CPNE1Q99829 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CPNE1Q99829 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CPNE1Q99829 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CPNE1Q99829 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CPNE1Q99829 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CPNE1Q99829 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CPNE1Q99829 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CPNE1Q99829 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CPNE1Q99829 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CPNE1Q99829 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CPNE1Q99829 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CPNE1Q99829 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CPNE1Q99829 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CPNE1Q99829 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CPNE1Q99829 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CPNE1Q99829 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CPNE1Q99829 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CPNE1Q99829 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CPNE1Q99829 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CPNE1Q99829 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CPNE1Q99829 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CPNE1Q99829 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CPNE1Q99829 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CPNE1Q99829 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CPNE1Q99829 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
CPNE1Q99829 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CPNE1Q99829 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CPNE1Q99829 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CPNE1Q99829 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CPNE1Q99829 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CPNE1Q99829 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CPNE1Q99829 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CPNE1Q99829 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CPNE1Q99829 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CPNE1Q99829 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CPNE1Q99829 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.4 ms