Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VAT1Q99536 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VAT1Q99536 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
VAT1Q99536 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VAT1Q99536 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
VAT1Q99536 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VAT1Q99536 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
VAT1Q99536 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VAT1Q99536 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VAT1Q99536 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VAT1Q99536 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VAT1Q99536 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VAT1Q99536 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
VAT1Q99536 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
VAT1Q99536 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VAT1Q99536 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VAT1Q99536 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VAT1Q99536 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VAT1Q99536 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VAT1Q99536 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VAT1Q99536 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VAT1Q99536 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VAT1Q99536 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VAT1Q99536 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VAT1Q99536 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VAT1Q99536 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
VAT1Q99536 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
VAT1Q99536 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VAT1Q99536 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VAT1Q99536 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VAT1Q99536 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VAT1Q99536 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VAT1Q99536 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VAT1Q99536 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VAT1Q99536 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
VAT1Q99536 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
VAT1Q99536 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
VAT1Q99536 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VAT1Q99536 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VAT1Q99536 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VAT1Q99536 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VAT1Q99536 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VAT1Q99536 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VAT1Q99536 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VAT1Q99536 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
VAT1Q99536 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VAT1Q99536 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VAT1Q99536 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VAT1Q99536 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VAT1Q99536 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VAT1Q99536 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VAT1Q99536 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VAT1Q99536 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VAT1Q99536 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VAT1Q99536 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VAT1Q99536 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VAT1Q99536 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VAT1Q99536 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VAT1Q99536 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VAT1Q99536 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
VAT1Q99536 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
VAT1Q99536 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
VAT1Q99536 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
VAT1Q99536 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
VAT1Q99536 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
VAT1Q99536 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VAT1Q99536 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
VAT1Q99536 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VAT1Q99536 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VAT1Q99536 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VAT1Q99536 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VAT1Q99536 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VAT1Q99536 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VAT1Q99536 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VAT1Q99536 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VAT1Q99536 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VAT1Q99536 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VAT1Q99536 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VAT1Q99536 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
VAT1Q99536 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VAT1Q99536 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
VAT1Q99536 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
VAT1Q99536 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VAT1Q99536 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
VAT1Q99536 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
VAT1Q99536 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VAT1Q99536 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VAT1Q99536 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
VAT1Q99536 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
VAT1Q99536 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
VAT1Q99536 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
VAT1Q99536 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
VAT1Q99536 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
VAT1Q99536 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
VAT1Q99536 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
VAT1Q99536 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
VAT1Q99536 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VAT1Q99536 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VAT1Q99536 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VAT1Q99536 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms