Protein–RNA interactions for Protein: Q99439

CNN2, Calponin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN2Q99439 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNN2Q99439 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNN2Q99439 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNN2Q99439 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNN2Q99439 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNN2Q99439 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNN2Q99439 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNN2Q99439 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNN2Q99439 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNN2Q99439 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNN2Q99439 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CNN2Q99439 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNN2Q99439 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNN2Q99439 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNN2Q99439 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNN2Q99439 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNN2Q99439 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNN2Q99439 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CNN2Q99439 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNN2Q99439 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNN2Q99439 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNN2Q99439 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNN2Q99439 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNN2Q99439 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNN2Q99439 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNN2Q99439 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CNN2Q99439 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNN2Q99439 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNN2Q99439 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNN2Q99439 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNN2Q99439 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNN2Q99439 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNN2Q99439 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CNN2Q99439 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNN2Q99439 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNN2Q99439 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNN2Q99439 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNN2Q99439 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNN2Q99439 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNN2Q99439 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNN2Q99439 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNN2Q99439 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNN2Q99439 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNN2Q99439 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNN2Q99439 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNN2Q99439 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNN2Q99439 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNN2Q99439 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNN2Q99439 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNN2Q99439 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNN2Q99439 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNN2Q99439 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNN2Q99439 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNN2Q99439 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNN2Q99439 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNN2Q99439 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNN2Q99439 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNN2Q99439 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNN2Q99439 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNN2Q99439 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNN2Q99439 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNN2Q99439 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CNN2Q99439 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNN2Q99439 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNN2Q99439 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNN2Q99439 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNN2Q99439 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNN2Q99439 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CNN2Q99439 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNN2Q99439 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNN2Q99439 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNN2Q99439 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNN2Q99439 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNN2Q99439 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNN2Q99439 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNN2Q99439 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNN2Q99439 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNN2Q99439 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNN2Q99439 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNN2Q99439 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNN2Q99439 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNN2Q99439 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNN2Q99439 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CNN2Q99439 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNN2Q99439 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNN2Q99439 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNN2Q99439 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNN2Q99439 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNN2Q99439 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNN2Q99439 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNN2Q99439 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNN2Q99439 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNN2Q99439 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNN2Q99439 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNN2Q99439 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNN2Q99439 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNN2Q99439 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNN2Q99439 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNN2Q99439 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNN2Q99439 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms