Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CITED4Q96RK1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CITED4Q96RK1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CITED4Q96RK1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CITED4Q96RK1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CITED4Q96RK1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CITED4Q96RK1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CITED4Q96RK1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CITED4Q96RK1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CITED4Q96RK1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CITED4Q96RK1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CITED4Q96RK1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CITED4Q96RK1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CITED4Q96RK1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CITED4Q96RK1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CITED4Q96RK1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CITED4Q96RK1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CITED4Q96RK1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CITED4Q96RK1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CITED4Q96RK1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CITED4Q96RK1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CITED4Q96RK1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CITED4Q96RK1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CITED4Q96RK1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CITED4Q96RK1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CITED4Q96RK1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CITED4Q96RK1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CITED4Q96RK1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CITED4Q96RK1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CITED4Q96RK1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CITED4Q96RK1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CITED4Q96RK1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CITED4Q96RK1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CITED4Q96RK1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CITED4Q96RK1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CITED4Q96RK1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CITED4Q96RK1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CITED4Q96RK1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CITED4Q96RK1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CITED4Q96RK1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CITED4Q96RK1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CITED4Q96RK1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CITED4Q96RK1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CITED4Q96RK1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CITED4Q96RK1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CITED4Q96RK1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CITED4Q96RK1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CITED4Q96RK1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CITED4Q96RK1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CITED4Q96RK1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CITED4Q96RK1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CITED4Q96RK1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CITED4Q96RK1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CITED4Q96RK1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CITED4Q96RK1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CITED4Q96RK1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CITED4Q96RK1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CITED4Q96RK1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CITED4Q96RK1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CITED4Q96RK1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CITED4Q96RK1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CITED4Q96RK1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CITED4Q96RK1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CITED4Q96RK1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CITED4Q96RK1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CITED4Q96RK1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CITED4Q96RK1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CITED4Q96RK1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CITED4Q96RK1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CITED4Q96RK1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CITED4Q96RK1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CITED4Q96RK1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CITED4Q96RK1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CITED4Q96RK1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CITED4Q96RK1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CITED4Q96RK1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CITED4Q96RK1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CITED4Q96RK1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CITED4Q96RK1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CITED4Q96RK1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CITED4Q96RK1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CITED4Q96RK1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CITED4Q96RK1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CITED4Q96RK1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CITED4Q96RK1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CITED4Q96RK1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CITED4Q96RK1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CITED4Q96RK1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CITED4Q96RK1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CITED4Q96RK1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CITED4Q96RK1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CITED4Q96RK1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CITED4Q96RK1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CITED4Q96RK1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CITED4Q96RK1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CITED4Q96RK1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CITED4Q96RK1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CITED4Q96RK1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CITED4Q96RK1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CITED4Q96RK1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms