Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRRC1Q96M27 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRRC1Q96M27 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRRC1Q96M27 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRRC1Q96M27 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRRC1Q96M27 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRRC1Q96M27 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRRC1Q96M27 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRRC1Q96M27 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRRC1Q96M27 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRRC1Q96M27 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRRC1Q96M27 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRRC1Q96M27 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRRC1Q96M27 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRRC1Q96M27 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRRC1Q96M27 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRRC1Q96M27 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PRRC1Q96M27 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRRC1Q96M27 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRRC1Q96M27 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRRC1Q96M27 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRRC1Q96M27 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRRC1Q96M27 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRRC1Q96M27 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRRC1Q96M27 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRRC1Q96M27 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRRC1Q96M27 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRRC1Q96M27 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRRC1Q96M27 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PRRC1Q96M27 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRRC1Q96M27 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRRC1Q96M27 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRRC1Q96M27 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRRC1Q96M27 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRRC1Q96M27 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRRC1Q96M27 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PRRC1Q96M27 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRRC1Q96M27 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRRC1Q96M27 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRRC1Q96M27 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRRC1Q96M27 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRRC1Q96M27 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRRC1Q96M27 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRRC1Q96M27 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRRC1Q96M27 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRRC1Q96M27 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRRC1Q96M27 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRRC1Q96M27 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRRC1Q96M27 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRRC1Q96M27 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRRC1Q96M27 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRRC1Q96M27 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRRC1Q96M27 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRRC1Q96M27 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRRC1Q96M27 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRRC1Q96M27 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PRRC1Q96M27 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRRC1Q96M27 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRRC1Q96M27 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRRC1Q96M27 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRRC1Q96M27 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRRC1Q96M27 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRRC1Q96M27 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRRC1Q96M27 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRRC1Q96M27 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRRC1Q96M27 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRRC1Q96M27 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRRC1Q96M27 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRRC1Q96M27 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRRC1Q96M27 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRRC1Q96M27 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRRC1Q96M27 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRRC1Q96M27 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRRC1Q96M27 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRRC1Q96M27 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRRC1Q96M27 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRRC1Q96M27 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PRRC1Q96M27 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PRRC1Q96M27 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRRC1Q96M27 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRRC1Q96M27 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRRC1Q96M27 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRRC1Q96M27 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRRC1Q96M27 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRRC1Q96M27 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRRC1Q96M27 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRRC1Q96M27 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRRC1Q96M27 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRRC1Q96M27 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRRC1Q96M27 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRRC1Q96M27 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRRC1Q96M27 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRRC1Q96M27 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRRC1Q96M27 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRRC1Q96M27 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRRC1Q96M27 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRRC1Q96M27 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRRC1Q96M27 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRRC1Q96M27 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRRC1Q96M27 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms