Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LINC00208Q96KT6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LINC00208Q96KT6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LINC00208Q96KT6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LINC00208Q96KT6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LINC00208Q96KT6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LINC00208Q96KT6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LINC00208Q96KT6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LINC00208Q96KT6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
LINC00208Q96KT6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00208Q96KT6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00208Q96KT6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00208Q96KT6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00208Q96KT6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00208Q96KT6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00208Q96KT6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00208Q96KT6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00208Q96KT6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00208Q96KT6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00208Q96KT6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00208Q96KT6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00208Q96KT6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00208Q96KT6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00208Q96KT6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00208Q96KT6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00208Q96KT6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00208Q96KT6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00208Q96KT6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00208Q96KT6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00208Q96KT6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00208Q96KT6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00208Q96KT6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LINC00208Q96KT6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LINC00208Q96KT6 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LINC00208Q96KT6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
LINC00208Q96KT6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LINC00208Q96KT6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LINC00208Q96KT6 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
LINC00208Q96KT6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
LINC00208Q96KT6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LINC00208Q96KT6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LINC00208Q96KT6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LINC00208Q96KT6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LINC00208Q96KT6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LINC00208Q96KT6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LINC00208Q96KT6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
LINC00208Q96KT6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LINC00208Q96KT6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LINC00208Q96KT6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LINC00208Q96KT6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC00208Q96KT6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC00208Q96KT6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC00208Q96KT6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC00208Q96KT6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC00208Q96KT6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00208Q96KT6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00208Q96KT6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00208Q96KT6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC00208Q96KT6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC00208Q96KT6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC00208Q96KT6 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC00208Q96KT6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC00208Q96KT6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC00208Q96KT6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC00208Q96KT6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC00208Q96KT6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00208Q96KT6 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00208Q96KT6 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00208Q96KT6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00208Q96KT6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00208Q96KT6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00208Q96KT6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00208Q96KT6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00208Q96KT6 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00208Q96KT6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC00208Q96KT6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC00208Q96KT6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC00208Q96KT6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC00208Q96KT6 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC00208Q96KT6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC00208Q96KT6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC00208Q96KT6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC00208Q96KT6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC00208Q96KT6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC00208Q96KT6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00208Q96KT6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00208Q96KT6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00208Q96KT6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00208Q96KT6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00208Q96KT6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00208Q96KT6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00208Q96KT6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00208Q96KT6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00208Q96KT6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00208Q96KT6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00208Q96KT6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00208Q96KT6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00208Q96KT6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00208Q96KT6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00208Q96KT6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms