Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC41.12■■■■■ 4.17
LRRIQ1Q96JM4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
LRRIQ1Q96JM4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
LRRIQ1Q96JM4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC41.1■■■■■ 4.17
LRRIQ1Q96JM4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.09■■■■■ 4.17
LRRIQ1Q96JM4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC41.07■■■■■ 4.16
LRRIQ1Q96JM4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
LRRIQ1Q96JM4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
LRRIQ1Q96JM4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
LRRIQ1Q96JM4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
LRRIQ1Q96JM4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
LRRIQ1Q96JM4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
LRRIQ1Q96JM4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
LRRIQ1Q96JM4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
LRRIQ1Q96JM4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC41■■■■■ 4.15
LRRIQ1Q96JM4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
LRRIQ1Q96JM4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.99■■■■■ 4.15
LRRIQ1Q96JM4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
LRRIQ1Q96JM4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
LRRIQ1Q96JM4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
LRRIQ1Q96JM4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.97■■■■■ 4.15
LRRIQ1Q96JM4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
LRRIQ1Q96JM4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC40.95■■■■■ 4.15
LRRIQ1Q96JM4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC40.94■■■■■ 4.14
LRRIQ1Q96JM4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
LRRIQ1Q96JM4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC40.93■■■■■ 4.14
LRRIQ1Q96JM4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC40.92■■■■■ 4.14
LRRIQ1Q96JM4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC40.91■■■■■ 4.14
LRRIQ1Q96JM4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
LRRIQ1Q96JM4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC40.9■■■■■ 4.14
LRRIQ1Q96JM4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
LRRIQ1Q96JM4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
LRRIQ1Q96JM4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
LRRIQ1Q96JM4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC40.9■■■■■ 4.14
LRRIQ1Q96JM4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC40.89■■■■■ 4.14
LRRIQ1Q96JM4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC40.89■■■■■ 4.14
LRRIQ1Q96JM4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.89■■■■■ 4.14
LRRIQ1Q96JM4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.14
LRRIQ1Q96JM4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC40.87■■■■■ 4.13
LRRIQ1Q96JM4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC40.87■■■■■ 4.13
LRRIQ1Q96JM4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
LRRIQ1Q96JM4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
LRRIQ1Q96JM4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
LRRIQ1Q96JM4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
LRRIQ1Q96JM4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
LRRIQ1Q96JM4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
LRRIQ1Q96JM4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
LRRIQ1Q96JM4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
LRRIQ1Q96JM4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
LRRIQ1Q96JM4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
LRRIQ1Q96JM4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
LRRIQ1Q96JM4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
LRRIQ1Q96JM4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
LRRIQ1Q96JM4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.8■■■■■ 4.12
LRRIQ1Q96JM4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
LRRIQ1Q96JM4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC40.79■■■■■ 4.12
LRRIQ1Q96JM4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC40.79■■■■■ 4.12
LRRIQ1Q96JM4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC40.78■■■■■ 4.12
LRRIQ1Q96JM4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC40.78■■■■■ 4.12
LRRIQ1Q96JM4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.77■■■■■ 4.12
LRRIQ1Q96JM4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC40.76■■■■■ 4.12
LRRIQ1Q96JM4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
LRRIQ1Q96JM4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.11
LRRIQ1Q96JM4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC40.76■■■■■ 4.11
LRRIQ1Q96JM4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
LRRIQ1Q96JM4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC40.75■■■■■ 4.11
LRRIQ1Q96JM4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.75■■■■■ 4.11
LRRIQ1Q96JM4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC40.75■■■■■ 4.11
LRRIQ1Q96JM4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC40.75■■■■■ 4.11
LRRIQ1Q96JM4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
LRRIQ1Q96JM4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC40.74■■■■■ 4.11
LRRIQ1Q96JM4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
LRRIQ1Q96JM4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
LRRIQ1Q96JM4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC40.73■■■■■ 4.11
LRRIQ1Q96JM4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
LRRIQ1Q96JM4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.72■■■■■ 4.11
LRRIQ1Q96JM4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC40.72■■■■■ 4.11
LRRIQ1Q96JM4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
LRRIQ1Q96JM4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.71■■■■■ 4.11
LRRIQ1Q96JM4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.71■■■■■ 4.11
LRRIQ1Q96JM4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC40.7■■■■■ 4.11
LRRIQ1Q96JM4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
LRRIQ1Q96JM4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC40.7■■■■■ 4.11
LRRIQ1Q96JM4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
LRRIQ1Q96JM4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
LRRIQ1Q96JM4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
LRRIQ1Q96JM4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
LRRIQ1Q96JM4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
LRRIQ1Q96JM4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC40.66■■■■■ 4.1
LRRIQ1Q96JM4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
LRRIQ1Q96JM4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
LRRIQ1Q96JM4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC40.64■■■■■ 4.1
LRRIQ1Q96JM4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC40.63■■■■■ 4.1
LRRIQ1Q96JM4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
LRRIQ1Q96JM4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
LRRIQ1Q96JM4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC40.62■■■■■ 4.09
LRRIQ1Q96JM4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
LRRIQ1Q96JM4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC40.58■■■■■ 4.09
LRRIQ1Q96JM4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC40.56■■■■■ 4.08
LRRIQ1Q96JM4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms