Protein–RNA interactions for Protein: Q96I45

TMEM141, Transmembrane protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM141Q96I45 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM141Q96I45 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM141Q96I45 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM141Q96I45 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM141Q96I45 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM141Q96I45 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM141Q96I45 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM141Q96I45 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM141Q96I45 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM141Q96I45 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM141Q96I45 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM141Q96I45 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM141Q96I45 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM141Q96I45 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM141Q96I45 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM141Q96I45 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM141Q96I45 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM141Q96I45 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM141Q96I45 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM141Q96I45 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM141Q96I45 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM141Q96I45 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM141Q96I45 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM141Q96I45 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM141Q96I45 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM141Q96I45 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM141Q96I45 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM141Q96I45 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM141Q96I45 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM141Q96I45 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM141Q96I45 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM141Q96I45 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM141Q96I45 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM141Q96I45 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM141Q96I45 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM141Q96I45 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM141Q96I45 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM141Q96I45 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM141Q96I45 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM141Q96I45 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM141Q96I45 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM141Q96I45 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM141Q96I45 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM141Q96I45 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM141Q96I45 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM141Q96I45 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM141Q96I45 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM141Q96I45 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM141Q96I45 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM141Q96I45 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM141Q96I45 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM141Q96I45 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM141Q96I45 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM141Q96I45 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM141Q96I45 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM141Q96I45 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM141Q96I45 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM141Q96I45 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM141Q96I45 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM141Q96I45 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM141Q96I45 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM141Q96I45 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM141Q96I45 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM141Q96I45 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM141Q96I45 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM141Q96I45 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM141Q96I45 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM141Q96I45 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM141Q96I45 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM141Q96I45 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM141Q96I45 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM141Q96I45 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM141Q96I45 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM141Q96I45 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM141Q96I45 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM141Q96I45 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM141Q96I45 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM141Q96I45 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM141Q96I45 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM141Q96I45 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM141Q96I45 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM141Q96I45 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM141Q96I45 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM141Q96I45 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM141Q96I45 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM141Q96I45 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM141Q96I45 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM141Q96I45 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM141Q96I45 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM141Q96I45 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM141Q96I45 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM141Q96I45 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM141Q96I45 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM141Q96I45 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM141Q96I45 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM141Q96I45 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM141Q96I45 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM141Q96I45 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM141Q96I45 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM141Q96I45 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1000.8 ms