Protein–RNA interactions for Protein: Q96H12

MSANTD3, Myb/SANT-like DNA-binding domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSANTD3Q96H12 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MSANTD3Q96H12 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MSANTD3Q96H12 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MSANTD3Q96H12 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MSANTD3Q96H12 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
MSANTD3Q96H12 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MSANTD3Q96H12 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MSANTD3Q96H12 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
MSANTD3Q96H12 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
MSANTD3Q96H12 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MSANTD3Q96H12 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MSANTD3Q96H12 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MSANTD3Q96H12 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MSANTD3Q96H12 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MSANTD3Q96H12 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MSANTD3Q96H12 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MSANTD3Q96H12 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MSANTD3Q96H12 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
MSANTD3Q96H12 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MSANTD3Q96H12 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MSANTD3Q96H12 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MSANTD3Q96H12 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MSANTD3Q96H12 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MSANTD3Q96H12 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MSANTD3Q96H12 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MSANTD3Q96H12 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MSANTD3Q96H12 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MSANTD3Q96H12 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MSANTD3Q96H12 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MSANTD3Q96H12 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MSANTD3Q96H12 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MSANTD3Q96H12 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MSANTD3Q96H12 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MSANTD3Q96H12 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MSANTD3Q96H12 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MSANTD3Q96H12 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MSANTD3Q96H12 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
MSANTD3Q96H12 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
MSANTD3Q96H12 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MSANTD3Q96H12 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MSANTD3Q96H12 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
MSANTD3Q96H12 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MSANTD3Q96H12 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MSANTD3Q96H12 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
MSANTD3Q96H12 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MSANTD3Q96H12 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MSANTD3Q96H12 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MSANTD3Q96H12 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MSANTD3Q96H12 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MSANTD3Q96H12 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MSANTD3Q96H12 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MSANTD3Q96H12 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MSANTD3Q96H12 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MSANTD3Q96H12 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MSANTD3Q96H12 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MSANTD3Q96H12 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MSANTD3Q96H12 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MSANTD3Q96H12 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MSANTD3Q96H12 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MSANTD3Q96H12 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
MSANTD3Q96H12 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
MSANTD3Q96H12 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
MSANTD3Q96H12 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MSANTD3Q96H12 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MSANTD3Q96H12 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MSANTD3Q96H12 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MSANTD3Q96H12 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MSANTD3Q96H12 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MSANTD3Q96H12 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MSANTD3Q96H12 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MSANTD3Q96H12 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MSANTD3Q96H12 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MSANTD3Q96H12 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MSANTD3Q96H12 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MSANTD3Q96H12 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MSANTD3Q96H12 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MSANTD3Q96H12 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MSANTD3Q96H12 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
MSANTD3Q96H12 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MSANTD3Q96H12 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MSANTD3Q96H12 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MSANTD3Q96H12 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MSANTD3Q96H12 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MSANTD3Q96H12 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MSANTD3Q96H12 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MSANTD3Q96H12 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
MSANTD3Q96H12 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MSANTD3Q96H12 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MSANTD3Q96H12 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MSANTD3Q96H12 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
MSANTD3Q96H12 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MSANTD3Q96H12 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MSANTD3Q96H12 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MSANTD3Q96H12 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MSANTD3Q96H12 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MSANTD3Q96H12 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MSANTD3Q96H12 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
MSANTD3Q96H12 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MSANTD3Q96H12 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
MSANTD3Q96H12 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms