Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX8

RTP4, Receptor-transporting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP4Q96DX8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RTP4Q96DX8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
RTP4Q96DX8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RTP4Q96DX8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RTP4Q96DX8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RTP4Q96DX8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RTP4Q96DX8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RTP4Q96DX8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RTP4Q96DX8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RTP4Q96DX8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RTP4Q96DX8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RTP4Q96DX8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
RTP4Q96DX8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RTP4Q96DX8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RTP4Q96DX8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RTP4Q96DX8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RTP4Q96DX8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
RTP4Q96DX8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RTP4Q96DX8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RTP4Q96DX8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RTP4Q96DX8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RTP4Q96DX8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RTP4Q96DX8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RTP4Q96DX8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RTP4Q96DX8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RTP4Q96DX8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RTP4Q96DX8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RTP4Q96DX8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RTP4Q96DX8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RTP4Q96DX8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RTP4Q96DX8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RTP4Q96DX8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RTP4Q96DX8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RTP4Q96DX8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RTP4Q96DX8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RTP4Q96DX8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RTP4Q96DX8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RTP4Q96DX8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RTP4Q96DX8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RTP4Q96DX8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RTP4Q96DX8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RTP4Q96DX8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RTP4Q96DX8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
RTP4Q96DX8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
RTP4Q96DX8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RTP4Q96DX8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RTP4Q96DX8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RTP4Q96DX8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
RTP4Q96DX8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RTP4Q96DX8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RTP4Q96DX8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RTP4Q96DX8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RTP4Q96DX8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RTP4Q96DX8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RTP4Q96DX8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RTP4Q96DX8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RTP4Q96DX8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RTP4Q96DX8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RTP4Q96DX8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RTP4Q96DX8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RTP4Q96DX8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RTP4Q96DX8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RTP4Q96DX8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RTP4Q96DX8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RTP4Q96DX8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RTP4Q96DX8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RTP4Q96DX8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RTP4Q96DX8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RTP4Q96DX8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RTP4Q96DX8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RTP4Q96DX8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RTP4Q96DX8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RTP4Q96DX8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RTP4Q96DX8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RTP4Q96DX8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
RTP4Q96DX8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RTP4Q96DX8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RTP4Q96DX8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RTP4Q96DX8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RTP4Q96DX8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RTP4Q96DX8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RTP4Q96DX8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RTP4Q96DX8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RTP4Q96DX8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RTP4Q96DX8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RTP4Q96DX8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RTP4Q96DX8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RTP4Q96DX8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RTP4Q96DX8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RTP4Q96DX8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RTP4Q96DX8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RTP4Q96DX8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RTP4Q96DX8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RTP4Q96DX8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RTP4Q96DX8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RTP4Q96DX8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RTP4Q96DX8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RTP4Q96DX8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RTP4Q96DX8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RTP4Q96DX8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms