Protein–RNA interactions for Protein: Q96DI7

SNRNP40, U5 small nuclear ribonucleoprotein 40 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP40Q96DI7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNRNP40Q96DI7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNRNP40Q96DI7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNRNP40Q96DI7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNRNP40Q96DI7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNRNP40Q96DI7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNRNP40Q96DI7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNRNP40Q96DI7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNRNP40Q96DI7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SNRNP40Q96DI7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNRNP40Q96DI7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNRNP40Q96DI7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNRNP40Q96DI7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNRNP40Q96DI7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNRNP40Q96DI7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SNRNP40Q96DI7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNRNP40Q96DI7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNRNP40Q96DI7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNRNP40Q96DI7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNRNP40Q96DI7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNRNP40Q96DI7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNRNP40Q96DI7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNRNP40Q96DI7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNRNP40Q96DI7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNRNP40Q96DI7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNRNP40Q96DI7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNRNP40Q96DI7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNRNP40Q96DI7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNRNP40Q96DI7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNRNP40Q96DI7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNRNP40Q96DI7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SNRNP40Q96DI7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNRNP40Q96DI7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNRNP40Q96DI7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNRNP40Q96DI7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNRNP40Q96DI7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNRNP40Q96DI7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNRNP40Q96DI7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNRNP40Q96DI7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNRNP40Q96DI7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNRNP40Q96DI7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNRNP40Q96DI7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNRNP40Q96DI7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNRNP40Q96DI7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNRNP40Q96DI7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNRNP40Q96DI7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNRNP40Q96DI7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNRNP40Q96DI7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SNRNP40Q96DI7 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNRNP40Q96DI7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNRNP40Q96DI7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNRNP40Q96DI7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNRNP40Q96DI7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNRNP40Q96DI7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNRNP40Q96DI7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SNRNP40Q96DI7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNRNP40Q96DI7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNRNP40Q96DI7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNRNP40Q96DI7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNRNP40Q96DI7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNRNP40Q96DI7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNRNP40Q96DI7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNRNP40Q96DI7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNRNP40Q96DI7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNRNP40Q96DI7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNRNP40Q96DI7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNRNP40Q96DI7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNRNP40Q96DI7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNRNP40Q96DI7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNRNP40Q96DI7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNRNP40Q96DI7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNRNP40Q96DI7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SNRNP40Q96DI7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNRNP40Q96DI7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNRNP40Q96DI7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNRNP40Q96DI7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNRNP40Q96DI7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNRNP40Q96DI7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNRNP40Q96DI7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNRNP40Q96DI7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNRNP40Q96DI7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNRNP40Q96DI7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SNRNP40Q96DI7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SNRNP40Q96DI7 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNRNP40Q96DI7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNRNP40Q96DI7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNRNP40Q96DI7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNRNP40Q96DI7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNRNP40Q96DI7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNRNP40Q96DI7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNRNP40Q96DI7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNRNP40Q96DI7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SNRNP40Q96DI7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNRNP40Q96DI7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNRNP40Q96DI7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNRNP40Q96DI7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNRNP40Q96DI7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNRNP40Q96DI7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNRNP40Q96DI7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNRNP40Q96DI7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms