Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD0

LRRC39, Leucine-rich repeat-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC39Q96DD0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRC39Q96DD0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRC39Q96DD0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRC39Q96DD0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRC39Q96DD0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRC39Q96DD0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRC39Q96DD0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRC39Q96DD0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRC39Q96DD0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRC39Q96DD0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRC39Q96DD0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRC39Q96DD0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRC39Q96DD0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRC39Q96DD0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRC39Q96DD0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRC39Q96DD0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRC39Q96DD0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRC39Q96DD0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRC39Q96DD0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRC39Q96DD0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRC39Q96DD0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRC39Q96DD0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRC39Q96DD0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRRC39Q96DD0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRRC39Q96DD0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRRC39Q96DD0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LRRC39Q96DD0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LRRC39Q96DD0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
LRRC39Q96DD0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LRRC39Q96DD0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
LRRC39Q96DD0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRC39Q96DD0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRC39Q96DD0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRC39Q96DD0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRC39Q96DD0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRC39Q96DD0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRC39Q96DD0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRC39Q96DD0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRC39Q96DD0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRC39Q96DD0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRC39Q96DD0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRC39Q96DD0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRC39Q96DD0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRC39Q96DD0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC39Q96DD0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC39Q96DD0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC39Q96DD0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC39Q96DD0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC39Q96DD0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC39Q96DD0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC39Q96DD0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC39Q96DD0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC39Q96DD0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC39Q96DD0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC39Q96DD0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC39Q96DD0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC39Q96DD0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC39Q96DD0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC39Q96DD0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC39Q96DD0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC39Q96DD0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC39Q96DD0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC39Q96DD0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC39Q96DD0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC39Q96DD0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC39Q96DD0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC39Q96DD0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC39Q96DD0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC39Q96DD0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC39Q96DD0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC39Q96DD0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC39Q96DD0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC39Q96DD0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC39Q96DD0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC39Q96DD0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC39Q96DD0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC39Q96DD0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC39Q96DD0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC39Q96DD0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC39Q96DD0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC39Q96DD0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC39Q96DD0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC39Q96DD0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC39Q96DD0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC39Q96DD0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC39Q96DD0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC39Q96DD0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC39Q96DD0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC39Q96DD0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC39Q96DD0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC39Q96DD0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC39Q96DD0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC39Q96DD0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC39Q96DD0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC39Q96DD0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LRRC39Q96DD0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LRRC39Q96DD0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LRRC39Q96DD0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC39Q96DD0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC39Q96DD0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms