Protein–RNA interactions for Protein: Q96D42

HAVCR1, Hepatitis A virus cellular receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAVCR1Q96D42 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HAVCR1Q96D42 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HAVCR1Q96D42 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HAVCR1Q96D42 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HAVCR1Q96D42 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HAVCR1Q96D42 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HAVCR1Q96D42 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HAVCR1Q96D42 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HAVCR1Q96D42 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HAVCR1Q96D42 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HAVCR1Q96D42 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HAVCR1Q96D42 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HAVCR1Q96D42 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HAVCR1Q96D42 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HAVCR1Q96D42 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HAVCR1Q96D42 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HAVCR1Q96D42 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HAVCR1Q96D42 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HAVCR1Q96D42 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HAVCR1Q96D42 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HAVCR1Q96D42 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HAVCR1Q96D42 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HAVCR1Q96D42 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HAVCR1Q96D42 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HAVCR1Q96D42 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HAVCR1Q96D42 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HAVCR1Q96D42 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HAVCR1Q96D42 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HAVCR1Q96D42 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HAVCR1Q96D42 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HAVCR1Q96D42 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HAVCR1Q96D42 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HAVCR1Q96D42 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HAVCR1Q96D42 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HAVCR1Q96D42 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HAVCR1Q96D42 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HAVCR1Q96D42 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HAVCR1Q96D42 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HAVCR1Q96D42 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HAVCR1Q96D42 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HAVCR1Q96D42 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HAVCR1Q96D42 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HAVCR1Q96D42 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HAVCR1Q96D42 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HAVCR1Q96D42 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HAVCR1Q96D42 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HAVCR1Q96D42 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HAVCR1Q96D42 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HAVCR1Q96D42 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HAVCR1Q96D42 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HAVCR1Q96D42 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HAVCR1Q96D42 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HAVCR1Q96D42 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HAVCR1Q96D42 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HAVCR1Q96D42 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HAVCR1Q96D42 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HAVCR1Q96D42 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HAVCR1Q96D42 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HAVCR1Q96D42 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HAVCR1Q96D42 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HAVCR1Q96D42 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HAVCR1Q96D42 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HAVCR1Q96D42 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HAVCR1Q96D42 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HAVCR1Q96D42 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HAVCR1Q96D42 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HAVCR1Q96D42 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HAVCR1Q96D42 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HAVCR1Q96D42 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HAVCR1Q96D42 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HAVCR1Q96D42 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HAVCR1Q96D42 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HAVCR1Q96D42 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HAVCR1Q96D42 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HAVCR1Q96D42 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HAVCR1Q96D42 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HAVCR1Q96D42 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HAVCR1Q96D42 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HAVCR1Q96D42 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HAVCR1Q96D42 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HAVCR1Q96D42 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HAVCR1Q96D42 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HAVCR1Q96D42 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HAVCR1Q96D42 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HAVCR1Q96D42 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HAVCR1Q96D42 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HAVCR1Q96D42 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HAVCR1Q96D42 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HAVCR1Q96D42 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HAVCR1Q96D42 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HAVCR1Q96D42 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HAVCR1Q96D42 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HAVCR1Q96D42 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HAVCR1Q96D42 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HAVCR1Q96D42 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HAVCR1Q96D42 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HAVCR1Q96D42 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HAVCR1Q96D42 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HAVCR1Q96D42 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HAVCR1Q96D42 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms