Protein–RNA interactions for Protein: Q96CB8

INTS12, Integrator complex subunit 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS12Q96CB8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
INTS12Q96CB8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
INTS12Q96CB8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
INTS12Q96CB8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
INTS12Q96CB8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
INTS12Q96CB8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
INTS12Q96CB8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
INTS12Q96CB8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
INTS12Q96CB8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
INTS12Q96CB8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
INTS12Q96CB8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
INTS12Q96CB8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
INTS12Q96CB8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
INTS12Q96CB8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
INTS12Q96CB8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
INTS12Q96CB8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
INTS12Q96CB8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
INTS12Q96CB8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
INTS12Q96CB8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
INTS12Q96CB8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
INTS12Q96CB8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
INTS12Q96CB8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
INTS12Q96CB8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
INTS12Q96CB8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
INTS12Q96CB8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
INTS12Q96CB8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
INTS12Q96CB8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
INTS12Q96CB8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
INTS12Q96CB8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
INTS12Q96CB8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
INTS12Q96CB8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
INTS12Q96CB8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
INTS12Q96CB8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
INTS12Q96CB8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
INTS12Q96CB8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
INTS12Q96CB8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
INTS12Q96CB8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
INTS12Q96CB8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
INTS12Q96CB8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
INTS12Q96CB8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
INTS12Q96CB8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
INTS12Q96CB8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
INTS12Q96CB8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
INTS12Q96CB8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
INTS12Q96CB8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
INTS12Q96CB8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
INTS12Q96CB8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
INTS12Q96CB8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
INTS12Q96CB8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
INTS12Q96CB8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
INTS12Q96CB8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
INTS12Q96CB8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
INTS12Q96CB8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
INTS12Q96CB8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
INTS12Q96CB8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
INTS12Q96CB8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
INTS12Q96CB8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
INTS12Q96CB8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
INTS12Q96CB8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
INTS12Q96CB8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
INTS12Q96CB8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
INTS12Q96CB8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
INTS12Q96CB8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
INTS12Q96CB8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
INTS12Q96CB8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
INTS12Q96CB8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
INTS12Q96CB8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
INTS12Q96CB8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
INTS12Q96CB8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
INTS12Q96CB8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
INTS12Q96CB8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
INTS12Q96CB8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
INTS12Q96CB8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
INTS12Q96CB8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
INTS12Q96CB8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
INTS12Q96CB8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
INTS12Q96CB8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
INTS12Q96CB8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
INTS12Q96CB8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
INTS12Q96CB8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
INTS12Q96CB8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
INTS12Q96CB8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
INTS12Q96CB8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
INTS12Q96CB8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
INTS12Q96CB8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
INTS12Q96CB8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
INTS12Q96CB8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
INTS12Q96CB8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
INTS12Q96CB8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
INTS12Q96CB8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
INTS12Q96CB8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
INTS12Q96CB8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
INTS12Q96CB8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
INTS12Q96CB8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
INTS12Q96CB8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
INTS12Q96CB8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
INTS12Q96CB8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
INTS12Q96CB8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
INTS12Q96CB8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
INTS12Q96CB8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms