Protein–RNA interactions for Protein: Q96AX9

MIB2, E3 ubiquitin-protein ligase MIB2, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIB2Q96AX9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MIB2Q96AX9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MIB2Q96AX9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MIB2Q96AX9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MIB2Q96AX9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MIB2Q96AX9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MIB2Q96AX9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MIB2Q96AX9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MIB2Q96AX9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MIB2Q96AX9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MIB2Q96AX9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MIB2Q96AX9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MIB2Q96AX9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MIB2Q96AX9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MIB2Q96AX9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MIB2Q96AX9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MIB2Q96AX9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MIB2Q96AX9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MIB2Q96AX9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MIB2Q96AX9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MIB2Q96AX9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MIB2Q96AX9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MIB2Q96AX9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MIB2Q96AX9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MIB2Q96AX9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MIB2Q96AX9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MIB2Q96AX9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MIB2Q96AX9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MIB2Q96AX9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MIB2Q96AX9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MIB2Q96AX9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MIB2Q96AX9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MIB2Q96AX9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MIB2Q96AX9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MIB2Q96AX9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MIB2Q96AX9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MIB2Q96AX9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MIB2Q96AX9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MIB2Q96AX9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MIB2Q96AX9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MIB2Q96AX9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MIB2Q96AX9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MIB2Q96AX9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MIB2Q96AX9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MIB2Q96AX9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MIB2Q96AX9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MIB2Q96AX9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MIB2Q96AX9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MIB2Q96AX9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MIB2Q96AX9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MIB2Q96AX9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MIB2Q96AX9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MIB2Q96AX9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MIB2Q96AX9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MIB2Q96AX9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MIB2Q96AX9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MIB2Q96AX9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MIB2Q96AX9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MIB2Q96AX9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MIB2Q96AX9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MIB2Q96AX9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MIB2Q96AX9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MIB2Q96AX9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MIB2Q96AX9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MIB2Q96AX9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MIB2Q96AX9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MIB2Q96AX9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MIB2Q96AX9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MIB2Q96AX9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MIB2Q96AX9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MIB2Q96AX9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MIB2Q96AX9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MIB2Q96AX9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MIB2Q96AX9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MIB2Q96AX9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MIB2Q96AX9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MIB2Q96AX9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MIB2Q96AX9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MIB2Q96AX9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MIB2Q96AX9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MIB2Q96AX9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MIB2Q96AX9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MIB2Q96AX9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MIB2Q96AX9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MIB2Q96AX9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MIB2Q96AX9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MIB2Q96AX9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MIB2Q96AX9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MIB2Q96AX9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MIB2Q96AX9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MIB2Q96AX9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MIB2Q96AX9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MIB2Q96AX9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MIB2Q96AX9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MIB2Q96AX9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MIB2Q96AX9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MIB2Q96AX9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MIB2Q96AX9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MIB2Q96AX9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MIB2Q96AX9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms