Protein–RNA interactions for Protein: Q96AQ1

CCDC74A, Coiled-coil domain-containing protein 74A, humanhuman

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Length 378 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74AQ96AQ1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC74AQ96AQ1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC74AQ96AQ1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC74AQ96AQ1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC74AQ96AQ1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC74AQ96AQ1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC74AQ96AQ1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC74AQ96AQ1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC74AQ96AQ1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC74AQ96AQ1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC74AQ96AQ1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC74AQ96AQ1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC74AQ96AQ1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC74AQ96AQ1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC74AQ96AQ1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC74AQ96AQ1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC74AQ96AQ1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC74AQ96AQ1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC74AQ96AQ1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC74AQ96AQ1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC74AQ96AQ1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC74AQ96AQ1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC74AQ96AQ1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC74AQ96AQ1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC74AQ96AQ1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC74AQ96AQ1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC74AQ96AQ1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC74AQ96AQ1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC74AQ96AQ1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC74AQ96AQ1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC74AQ96AQ1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC74AQ96AQ1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC74AQ96AQ1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC74AQ96AQ1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC74AQ96AQ1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC74AQ96AQ1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC74AQ96AQ1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC74AQ96AQ1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC74AQ96AQ1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC74AQ96AQ1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC74AQ96AQ1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC74AQ96AQ1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC74AQ96AQ1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC74AQ96AQ1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC74AQ96AQ1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC74AQ96AQ1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC74AQ96AQ1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC74AQ96AQ1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC74AQ96AQ1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC74AQ96AQ1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC74AQ96AQ1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC74AQ96AQ1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC74AQ96AQ1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC74AQ96AQ1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC74AQ96AQ1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC74AQ96AQ1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC74AQ96AQ1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC74AQ96AQ1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC74AQ96AQ1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC74AQ96AQ1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC74AQ96AQ1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC74AQ96AQ1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC74AQ96AQ1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC74AQ96AQ1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC74AQ96AQ1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC74AQ96AQ1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC74AQ96AQ1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC74AQ96AQ1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC74AQ96AQ1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC74AQ96AQ1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC74AQ96AQ1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC74AQ96AQ1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC74AQ96AQ1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC74AQ96AQ1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC74AQ96AQ1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC74AQ96AQ1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC74AQ96AQ1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC74AQ96AQ1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC74AQ96AQ1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC74AQ96AQ1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC74AQ96AQ1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC74AQ96AQ1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC74AQ96AQ1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC74AQ96AQ1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC74AQ96AQ1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC74AQ96AQ1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC74AQ96AQ1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC74AQ96AQ1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC74AQ96AQ1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC74AQ96AQ1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC74AQ96AQ1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC74AQ96AQ1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC74AQ96AQ1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC74AQ96AQ1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC74AQ96AQ1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC74AQ96AQ1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC74AQ96AQ1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC74AQ96AQ1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC74AQ96AQ1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC74AQ96AQ1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
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