Protein–RNA interactions for Protein: Q96A59

MARVELD3, MARVEL domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARVELD3Q96A59 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MARVELD3Q96A59 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MARVELD3Q96A59 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MARVELD3Q96A59 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MARVELD3Q96A59 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MARVELD3Q96A59 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MARVELD3Q96A59 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MARVELD3Q96A59 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MARVELD3Q96A59 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MARVELD3Q96A59 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MARVELD3Q96A59 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MARVELD3Q96A59 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MARVELD3Q96A59 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MARVELD3Q96A59 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MARVELD3Q96A59 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MARVELD3Q96A59 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MARVELD3Q96A59 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MARVELD3Q96A59 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MARVELD3Q96A59 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MARVELD3Q96A59 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MARVELD3Q96A59 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MARVELD3Q96A59 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MARVELD3Q96A59 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MARVELD3Q96A59 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MARVELD3Q96A59 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MARVELD3Q96A59 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MARVELD3Q96A59 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MARVELD3Q96A59 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MARVELD3Q96A59 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MARVELD3Q96A59 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MARVELD3Q96A59 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MARVELD3Q96A59 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MARVELD3Q96A59 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MARVELD3Q96A59 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MARVELD3Q96A59 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MARVELD3Q96A59 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MARVELD3Q96A59 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MARVELD3Q96A59 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MARVELD3Q96A59 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MARVELD3Q96A59 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MARVELD3Q96A59 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MARVELD3Q96A59 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MARVELD3Q96A59 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MARVELD3Q96A59 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MARVELD3Q96A59 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MARVELD3Q96A59 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MARVELD3Q96A59 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MARVELD3Q96A59 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MARVELD3Q96A59 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MARVELD3Q96A59 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MARVELD3Q96A59 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MARVELD3Q96A59 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MARVELD3Q96A59 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MARVELD3Q96A59 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MARVELD3Q96A59 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MARVELD3Q96A59 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MARVELD3Q96A59 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MARVELD3Q96A59 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MARVELD3Q96A59 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MARVELD3Q96A59 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MARVELD3Q96A59 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MARVELD3Q96A59 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MARVELD3Q96A59 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MARVELD3Q96A59 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MARVELD3Q96A59 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MARVELD3Q96A59 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MARVELD3Q96A59 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MARVELD3Q96A59 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MARVELD3Q96A59 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MARVELD3Q96A59 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MARVELD3Q96A59 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MARVELD3Q96A59 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MARVELD3Q96A59 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MARVELD3Q96A59 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MARVELD3Q96A59 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MARVELD3Q96A59 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARVELD3Q96A59 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MARVELD3Q96A59 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MARVELD3Q96A59 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MARVELD3Q96A59 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MARVELD3Q96A59 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MARVELD3Q96A59 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARVELD3Q96A59 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARVELD3Q96A59 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARVELD3Q96A59 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARVELD3Q96A59 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARVELD3Q96A59 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARVELD3Q96A59 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARVELD3Q96A59 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARVELD3Q96A59 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MARVELD3Q96A59 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MARVELD3Q96A59 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MARVELD3Q96A59 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MARVELD3Q96A59 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MARVELD3Q96A59 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MARVELD3Q96A59 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MARVELD3Q96A59 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MARVELD3Q96A59 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MARVELD3Q96A59 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MARVELD3Q96A59 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms