Protein–RNA interactions for Protein: Q969P6

TOP1MT, DNA topoisomerase I, mitochondrial, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1MTQ969P6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TOP1MTQ969P6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TOP1MTQ969P6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TOP1MTQ969P6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TOP1MTQ969P6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
TOP1MTQ969P6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TOP1MTQ969P6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TOP1MTQ969P6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TOP1MTQ969P6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TOP1MTQ969P6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TOP1MTQ969P6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
TOP1MTQ969P6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TOP1MTQ969P6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TOP1MTQ969P6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
TOP1MTQ969P6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TOP1MTQ969P6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TOP1MTQ969P6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TOP1MTQ969P6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TOP1MTQ969P6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TOP1MTQ969P6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TOP1MTQ969P6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TOP1MTQ969P6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TOP1MTQ969P6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TOP1MTQ969P6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TOP1MTQ969P6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TOP1MTQ969P6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TOP1MTQ969P6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TOP1MTQ969P6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TOP1MTQ969P6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TOP1MTQ969P6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
TOP1MTQ969P6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TOP1MTQ969P6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TOP1MTQ969P6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TOP1MTQ969P6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TOP1MTQ969P6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TOP1MTQ969P6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TOP1MTQ969P6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TOP1MTQ969P6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TOP1MTQ969P6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TOP1MTQ969P6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TOP1MTQ969P6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TOP1MTQ969P6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TOP1MTQ969P6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TOP1MTQ969P6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TOP1MTQ969P6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TOP1MTQ969P6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TOP1MTQ969P6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TOP1MTQ969P6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TOP1MTQ969P6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TOP1MTQ969P6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TOP1MTQ969P6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TOP1MTQ969P6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TOP1MTQ969P6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TOP1MTQ969P6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TOP1MTQ969P6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.12
TOP1MTQ969P6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TOP1MTQ969P6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TOP1MTQ969P6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TOP1MTQ969P6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TOP1MTQ969P6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TOP1MTQ969P6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TOP1MTQ969P6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TOP1MTQ969P6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TOP1MTQ969P6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TOP1MTQ969P6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TOP1MTQ969P6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TOP1MTQ969P6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TOP1MTQ969P6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TOP1MTQ969P6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TOP1MTQ969P6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TOP1MTQ969P6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TOP1MTQ969P6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TOP1MTQ969P6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TOP1MTQ969P6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TOP1MTQ969P6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TOP1MTQ969P6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TOP1MTQ969P6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TOP1MTQ969P6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TOP1MTQ969P6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TOP1MTQ969P6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TOP1MTQ969P6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TOP1MTQ969P6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TOP1MTQ969P6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TOP1MTQ969P6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TOP1MTQ969P6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TOP1MTQ969P6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TOP1MTQ969P6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TOP1MTQ969P6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TOP1MTQ969P6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TOP1MTQ969P6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TOP1MTQ969P6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TOP1MTQ969P6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TOP1MTQ969P6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TOP1MTQ969P6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TOP1MTQ969P6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TOP1MTQ969P6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TOP1MTQ969P6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TOP1MTQ969P6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TOP1MTQ969P6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TOP1MTQ969P6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
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