Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BHMTQ93088 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BHMTQ93088 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BHMTQ93088 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BHMTQ93088 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BHMTQ93088 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BHMTQ93088 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
BHMTQ93088 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BHMTQ93088 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
BHMTQ93088 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BHMTQ93088 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BHMTQ93088 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BHMTQ93088 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BHMTQ93088 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BHMTQ93088 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BHMTQ93088 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BHMTQ93088 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BHMTQ93088 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BHMTQ93088 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BHMTQ93088 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BHMTQ93088 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BHMTQ93088 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BHMTQ93088 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BHMTQ93088 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BHMTQ93088 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BHMTQ93088 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BHMTQ93088 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BHMTQ93088 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
BHMTQ93088 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
BHMTQ93088 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
BHMTQ93088 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
BHMTQ93088 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
BHMTQ93088 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
BHMTQ93088 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
BHMTQ93088 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
BHMTQ93088 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
BHMTQ93088 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
BHMTQ93088 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BHMTQ93088 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BHMTQ93088 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BHMTQ93088 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BHMTQ93088 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BHMTQ93088 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BHMTQ93088 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BHMTQ93088 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BHMTQ93088 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BHMTQ93088 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
BHMTQ93088 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BHMTQ93088 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BHMTQ93088 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BHMTQ93088 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BHMTQ93088 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BHMTQ93088 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BHMTQ93088 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BHMTQ93088 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BHMTQ93088 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
BHMTQ93088 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BHMTQ93088 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BHMTQ93088 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BHMTQ93088 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BHMTQ93088 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BHMTQ93088 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BHMTQ93088 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BHMTQ93088 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BHMTQ93088 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BHMTQ93088 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BHMTQ93088 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BHMTQ93088 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BHMTQ93088 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BHMTQ93088 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BHMTQ93088 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BHMTQ93088 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BHMTQ93088 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
BHMTQ93088 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
BHMTQ93088 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
BHMTQ93088 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
BHMTQ93088 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BHMTQ93088 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BHMTQ93088 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
BHMTQ93088 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BHMTQ93088 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BHMTQ93088 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BHMTQ93088 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BHMTQ93088 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BHMTQ93088 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BHMTQ93088 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BHMTQ93088 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BHMTQ93088 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BHMTQ93088 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BHMTQ93088 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
BHMTQ93088 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BHMTQ93088 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
BHMTQ93088 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BHMTQ93088 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BHMTQ93088 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BHMTQ93088 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BHMTQ93088 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BHMTQ93088 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BHMTQ93088 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BHMTQ93088 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms