Protein–RNA interactions for Protein: Q92837

FRAT1, Proto-oncogene FRAT1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRAT1Q92837 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
FRAT1Q92837 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
FRAT1Q92837 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
FRAT1Q92837 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
FRAT1Q92837 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
FRAT1Q92837 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
FRAT1Q92837 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
FRAT1Q92837 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
FRAT1Q92837 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
FRAT1Q92837 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
FRAT1Q92837 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
FRAT1Q92837 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
FRAT1Q92837 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
FRAT1Q92837 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
FRAT1Q92837 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
FRAT1Q92837 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
FRAT1Q92837 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
FRAT1Q92837 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
FRAT1Q92837 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC33.32■■■□□ 2.92
FRAT1Q92837 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
FRAT1Q92837 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
FRAT1Q92837 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
FRAT1Q92837 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
FRAT1Q92837 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
FRAT1Q92837 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
FRAT1Q92837 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
FRAT1Q92837 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
FRAT1Q92837 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
FRAT1Q92837 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
FRAT1Q92837 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
FRAT1Q92837 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
FRAT1Q92837 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
FRAT1Q92837 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
FRAT1Q92837 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
FRAT1Q92837 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
FRAT1Q92837 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
FRAT1Q92837 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
FRAT1Q92837 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
FRAT1Q92837 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
FRAT1Q92837 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
FRAT1Q92837 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
FRAT1Q92837 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
FRAT1Q92837 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
FRAT1Q92837 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
FRAT1Q92837 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
FRAT1Q92837 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
FRAT1Q92837 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
FRAT1Q92837 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
FRAT1Q92837 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
FRAT1Q92837 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
FRAT1Q92837 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
FRAT1Q92837 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
FRAT1Q92837 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
FRAT1Q92837 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
FRAT1Q92837 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
FRAT1Q92837 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
FRAT1Q92837 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
FRAT1Q92837 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
FRAT1Q92837 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
FRAT1Q92837 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
FRAT1Q92837 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
FRAT1Q92837 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
FRAT1Q92837 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC33.1■■■□□ 2.89
FRAT1Q92837 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
FRAT1Q92837 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
FRAT1Q92837 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
FRAT1Q92837 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
FRAT1Q92837 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
FRAT1Q92837 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
FRAT1Q92837 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.89
FRAT1Q92837 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
FRAT1Q92837 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
FRAT1Q92837 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
FRAT1Q92837 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
FRAT1Q92837 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
FRAT1Q92837 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
FRAT1Q92837 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
FRAT1Q92837 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
FRAT1Q92837 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
FRAT1Q92837 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
FRAT1Q92837 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
FRAT1Q92837 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
FRAT1Q92837 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
FRAT1Q92837 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
FRAT1Q92837 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
FRAT1Q92837 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
FRAT1Q92837 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
FRAT1Q92837 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
FRAT1Q92837 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
FRAT1Q92837 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
FRAT1Q92837 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
FRAT1Q92837 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
FRAT1Q92837 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
FRAT1Q92837 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
FRAT1Q92837 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
FRAT1Q92837 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC33■■■□□ 2.87
FRAT1Q92837 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
FRAT1Q92837 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
FRAT1Q92837 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
FRAT1Q92837 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms