Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD1

RAB2B, Ras-related protein Rab-2B, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB2BQ8WUD1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB2BQ8WUD1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB2BQ8WUD1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB2BQ8WUD1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB2BQ8WUD1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB2BQ8WUD1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB2BQ8WUD1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB2BQ8WUD1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB2BQ8WUD1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB2BQ8WUD1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB2BQ8WUD1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB2BQ8WUD1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB2BQ8WUD1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB2BQ8WUD1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB2BQ8WUD1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB2BQ8WUD1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB2BQ8WUD1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB2BQ8WUD1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB2BQ8WUD1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB2BQ8WUD1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB2BQ8WUD1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB2BQ8WUD1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB2BQ8WUD1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB2BQ8WUD1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAB2BQ8WUD1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB2BQ8WUD1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB2BQ8WUD1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB2BQ8WUD1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB2BQ8WUD1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB2BQ8WUD1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB2BQ8WUD1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB2BQ8WUD1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB2BQ8WUD1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB2BQ8WUD1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB2BQ8WUD1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB2BQ8WUD1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB2BQ8WUD1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB2BQ8WUD1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB2BQ8WUD1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB2BQ8WUD1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB2BQ8WUD1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB2BQ8WUD1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB2BQ8WUD1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB2BQ8WUD1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB2BQ8WUD1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB2BQ8WUD1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB2BQ8WUD1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB2BQ8WUD1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RAB2BQ8WUD1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RAB2BQ8WUD1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB2BQ8WUD1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB2BQ8WUD1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB2BQ8WUD1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB2BQ8WUD1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB2BQ8WUD1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB2BQ8WUD1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB2BQ8WUD1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB2BQ8WUD1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB2BQ8WUD1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB2BQ8WUD1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB2BQ8WUD1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB2BQ8WUD1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB2BQ8WUD1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB2BQ8WUD1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB2BQ8WUD1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB2BQ8WUD1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB2BQ8WUD1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB2BQ8WUD1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB2BQ8WUD1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB2BQ8WUD1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB2BQ8WUD1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB2BQ8WUD1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB2BQ8WUD1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB2BQ8WUD1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB2BQ8WUD1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB2BQ8WUD1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB2BQ8WUD1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB2BQ8WUD1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB2BQ8WUD1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB2BQ8WUD1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB2BQ8WUD1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB2BQ8WUD1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB2BQ8WUD1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB2BQ8WUD1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB2BQ8WUD1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB2BQ8WUD1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB2BQ8WUD1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB2BQ8WUD1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB2BQ8WUD1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB2BQ8WUD1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB2BQ8WUD1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB2BQ8WUD1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB2BQ8WUD1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB2BQ8WUD1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB2BQ8WUD1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB2BQ8WUD1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB2BQ8WUD1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB2BQ8WUD1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB2BQ8WUD1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB2BQ8WUD1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms