Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHU2

CFAP61, Cilia- and flagella-associated protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 1,237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP61Q8NHU2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CFAP61Q8NHU2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CFAP61Q8NHU2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CFAP61Q8NHU2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CFAP61Q8NHU2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CFAP61Q8NHU2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CFAP61Q8NHU2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CFAP61Q8NHU2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CFAP61Q8NHU2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CFAP61Q8NHU2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CFAP61Q8NHU2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CFAP61Q8NHU2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CFAP61Q8NHU2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CFAP61Q8NHU2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CFAP61Q8NHU2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CFAP61Q8NHU2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CFAP61Q8NHU2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CFAP61Q8NHU2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CFAP61Q8NHU2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CFAP61Q8NHU2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CFAP61Q8NHU2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CFAP61Q8NHU2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFAP61Q8NHU2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFAP61Q8NHU2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFAP61Q8NHU2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFAP61Q8NHU2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CFAP61Q8NHU2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFAP61Q8NHU2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFAP61Q8NHU2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFAP61Q8NHU2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CFAP61Q8NHU2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CFAP61Q8NHU2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CFAP61Q8NHU2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CFAP61Q8NHU2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CFAP61Q8NHU2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CFAP61Q8NHU2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CFAP61Q8NHU2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CFAP61Q8NHU2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CFAP61Q8NHU2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CFAP61Q8NHU2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CFAP61Q8NHU2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CFAP61Q8NHU2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CFAP61Q8NHU2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CFAP61Q8NHU2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CFAP61Q8NHU2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CFAP61Q8NHU2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CFAP61Q8NHU2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CFAP61Q8NHU2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CFAP61Q8NHU2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP61Q8NHU2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP61Q8NHU2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP61Q8NHU2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP61Q8NHU2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP61Q8NHU2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP61Q8NHU2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP61Q8NHU2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP61Q8NHU2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP61Q8NHU2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP61Q8NHU2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP61Q8NHU2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP61Q8NHU2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP61Q8NHU2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP61Q8NHU2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP61Q8NHU2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP61Q8NHU2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP61Q8NHU2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP61Q8NHU2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP61Q8NHU2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP61Q8NHU2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP61Q8NHU2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP61Q8NHU2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP61Q8NHU2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP61Q8NHU2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP61Q8NHU2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP61Q8NHU2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP61Q8NHU2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP61Q8NHU2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP61Q8NHU2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP61Q8NHU2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP61Q8NHU2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP61Q8NHU2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP61Q8NHU2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP61Q8NHU2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP61Q8NHU2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFAP61Q8NHU2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFAP61Q8NHU2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFAP61Q8NHU2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CFAP61Q8NHU2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CFAP61Q8NHU2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CFAP61Q8NHU2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CFAP61Q8NHU2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CFAP61Q8NHU2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CFAP61Q8NHU2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CFAP61Q8NHU2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CFAP61Q8NHU2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CFAP61Q8NHU2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CFAP61Q8NHU2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CFAP61Q8NHU2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CFAP61Q8NHU2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CFAP61Q8NHU2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms